Snakemake:在递归子工作流场景中引用输出超出父级

时间:2017-08-16 13:56:20

标签: workflow snakemake modularization

我有一个包含三层子工作流程的工作流程,其中wfA是wfB的子工作流程,是wfC的子工作流程。

执行wfC时,如果需要,wfA和wfB都会正确执行。

在wfC中我可以做wfB(" some / output")但是我不能做wfA(" some / output"),因为它会给出一个& #34;姓名' wfA'没有定义"错误。

这是支持的吗?还有别的方法吗?

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

目前,这不受支持,除了展平层次结构外,我认为没办法。