Question

我试图在其他人编写的代码中理解R中此语句的含义。

mymodel = lm(gene ~ ., data = mydata)

mydata如下：

> mydata
                 gene    cna rs11433683      PC1    PC2
TCGA.BH.A0C0 270.7446 0.1291          0 270.7446 0.1291
TCGA.A2.A3XY  87.9092 0.0128          1  87.9092 0.0128
TCGA.XX.A89A 255.1346 0.1530          1 255.1346 0.1530

我已经浏览了R帮助部分，了解如何解释.。我知道.通常不会被使用，但这就是我找到的

help(formula)

公式中有.的两种特殊解释。通常一个是在模型拟合函数的data参数的上下文中并且意味着“公式中没有其他列的所有列”：见 terms.formula。在update.formula，仅的上下文中，这意味着 '之前在公式的这一部分'

help(terms.formula)

AllowDotAsName：公式中的.通常是指剩余的   data中包含的变量。例外情况下，.可以视为一个   公式的非标准用途的名称。

data：一个数据框，可以从中推断出特殊符号.的含义。如果公式中没有.，则不使用。

但是，我不确定这些陈述的含义。有人能给我一个简单的例子，说明它在我上面提到的陈述和数据的背景下意味着什么？

Answer 1

在模型拟合函数的数据参数的上下文中，并且表示“公式中没有其他列的所有列”

正如它在盒子上所说的那样！

所以用

 mymodel = lm(gene ~ ., data = mydata)

您在公式的RHS中gene获得 mydata以外的所有变量

cna + rs11433683 + PC1 + PC2

据我所知，引用的短语清晰明确（......但你也可以通过尝试一些小例子看到它）

唯一可能不明显的是，如果你没有提供data论证，它会做什么（但是在terms.formula的帮助中回答了这个问题在你的报价中。）

Answer 2

意味着您要将基因与所有变量进行比较

R中lm（y~。）中点的含义

2 个答案: