从apache web请求调用时,python import rpy2.robjects不起作用

时间:2017-08-10 08:14:02

标签: python r rpy2

问题:

我的Test.py文件夹中有一个非常简单的python脚本("C:\Apache24\htdocs\Test\cgi-bin"),其中包含以下代码:

#!/Python/python
print("Content-type: text/html")
print()
import os
os.environ['R_HOME'] = 'C:\Program Files\R\R-3.4.1'
os.environ['R_USER'] = 'C:\Python\Lib\site-packages\rpy2'

# importing rpy2
import rpy2.robjects as robjects

# test : evaluating R code
robjects.r('''
        # create a function `f`
        f <- function(r, verbose=FALSE) {
            if (verbose) {
                cat("I am calling f().\n")
            }
            2 * pi * r
        }
        ''')

r_f = robjects.r['f']
res = r_f(3)
print(res[0])

现在在python shell中执行它时,它可以正常工作。但是,从Web请求(甚至是localhost)调用脚本只会无限期地加载页面。

其他信息:

我通过RemoteDesktopConnection在Windows Server 2008 R2 x64操作系统上工作

<小时/> 我的安装如下:

Python 3.6: "C:\Python" + rpy2 version: 2.8.6

R 3.4.1: "C:\Program Files\R\R-3.4.1"

Apache: "C:\Apache24"

<小时/> 我根据this post设置的import osos.environ['...命令,因为我无法使用全局系统变量进行设置。

但是我设置了环境变量(我能够在cmd.exe中启动R),但是如果没有上述命令,我的rpy2将无法工作(即使在python shell中)。

<小时/> 我的系统变量是:

Path: "...;C:\Python\Scripts\;C:\Python\;C:\Program Files\R\R-3.4.1\bin\x64"

R_HOME: "C:\Program Files\R\R-3.4.1"

R_USER: "C:\Python\Lib\site-packages\rpy2"

我知道我的apache服务器可以执行python脚本作为cgi(我有其他python脚本,通过web请求执行得很好)。它实际上只是 import rpy2.robjects 命令造成了麻烦

<小时/> 我在寻找解决方案时找到了this post,但我对服务器配置知之甚少,如果没有更详细的解释,我就无法做到。 如果我能提供更多详细信息,请告诉我。

非常感谢任何帮助!

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

显然这是发生的最明显/最愚蠢的事情。在我的python脚本中使用正斜杠而不是反斜杠确实解决了我的问题。所以我更新的代码如下:

#!/Python/python
print("Content-type: text/html")
print()
import os
os.environ['PYTHONHOME'] = 'C:/Python'
os.environ['PYTHONPATH'] = 'C:/Python/lib/site-packages'
os.environ['R_HOME'] = 'C:/Program Files/R/R-3.4.1'
os.environ['R_USER'] = 'C:/Python/Lib/site-packages/rpy2'

# importing rpy2
import rpy2.robjects as robjects

# test : evaluating R code
robjects.r('''
        # create a function `f`
        f <- function(r, verbose=FALSE) {
            if (verbose) {
                cat("I am calling f().\n")
            }
            2 * pi * r
        }
        ''')

r_f = robjects.r['f']
res = r_f(3)
print(res[0])

此脚本按照通过Web请求调用时的方式执行。