awk简单制表符分隔1到第n列

Question

我有一个制表符分隔的文件，我想要打印。的第一列。

我希望尽可能保持简单和可重复的方式：

awk -F" " '{print $1,"\t" ,$2, "\t", $3}' old.bed > new.bed

但是当我尝试对新文件进行进一步分析时，我收到一条错误消息，指出该文件的格式是意外的......

我用以下方法检查文件的内容：

cat -A new.bed | more

chr1     3000870     3000918$
chr1     3000870     3000918$
chr1     3000872     3000920$
chr1     3000872     3000920$
chr1     3000872     3000920$

看起来很正常......

出了什么问题，我该如何避免呢？

Answer 1

$不在文件中。它是-A的{​​{1}}标志，将其添加到显示中。来自cat的相关部分：

man cat

只需删除 -A, --show-all equivalent to -vET -E, --show-ends display $ at end of each line 标记，-A将不再显示。

此外，我不确定$命令是否完全符合您的预期。 输出实际上不是awk， 但是col1 tab col2 tab col3。 这是因为col1 space tab space col2 space tab space col3命令中的每个,都被字段分隔符替换，除此之外，您还要添加制表符。 这是一种将列标签分开的简单方法：

print

Answer 2

由于您的输入是制表符分隔的，因此您可以使用cut作为一种简单且可重现的方法：

cut -f 1-3 old.bed

至于您的$问题，janos已完全涵盖{{3}}。