在pycharm中同步.git目录

Question

我正在我的Windows 10机器上本地开发pycharm。并拥有一个带有ubuntu的来宾VM机器，其中包含我的远程部署服务器。我正在使用SFTP在两个环境之间进行同步。我的问题是，似乎pycharm使用本地基于Windows的git来本地管理git操作。因此它似乎有两个单独的.git目录，一个本地目录和一个远程目录。

我的问题是，如果我在远程机器上做一些东西，如“git checkout otherbranch”或任何其他远程和手动完成的提交操作。我希望遥控器和本地.git始终同步。

现在我知道它不同步因为这个配置：

我一直想知道是否删除“.git”目录是一种不好/危险的做法？如果是这样，那么实现目标的最佳途径是什么？

非常感谢任何帮助！