我刚开始使用foreach和%dopar%方法在R中进行并行处理,但我得到的结果令人困惑,与for循环不同;这是我用来测试那些方法的代码,以及我得到的结果:
library(plyr); library(doParallel); library(foreach)
cs <- makeCluster(2)
registerDoParallel(cs)
sfor_start <- Sys.time()
s_for=as.numeric()
for (i in 1:1000) {
s_for[i] = sqrt(i)
}
print(Sys.time() - sfor_start)
sdopar_start <- Sys.time()
sdopar=as.numeric()
foreach(k=1:1000) %dopar% {
sdopar[k] = sqrt(k)
}
print(Sys.time() - sdopar_start)
结果如下:
> s_for[1:10]; sdopar[1:10]
[1] 1.000000 1.414214 1.732051 2.000000 2.236068 2.449490 2.645751 2.828427 3.000000 3.162278
[1] NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
提前致谢:)
答案 0 :(得分:1)
请先阅读功能文档,然后再说它们不起作用。
foreach
更像是lapply
而不是for
- 循环。
因此,例如,foreach(k=1:1000) %dopar% sqrt(k)
提供与lapply(1:1000, sqrt)
相同的结果。
然而,在使用foreach
SEQUENTIALLY 时,您可以修改全局变量。然而,当使用并行性时,向量sdopar
被复制到每个“簇”,以便您修改副本,而不是初始对象。
所以,你必须按照@ChiPak提到的方式选择.combine = c
或之后使用do.call(sdopar, c)
。
PS:始终初始化迭代填充的向量(为了不生长向量的效率),例如:s_for <- double(1000)
。