Question

我正在尝试合并R中的许多csv文件。当我手动输入两个csv文件的名称时，它们共享一个公共列，并且merge命令正常工作。但是，每次需要执行此操作时，我都会输入太多文件来输入所有名称。

这很好用：

test <- merge(quant_dysmorph_data.csv, srs_adult.csv, by = "individual", all 
= TRUE)

我可以为看起来很好的合并命令的输入做类似的事情：

cat(ls(pattern = ".csv"), sep = ",")

返回： bapq.csv，bapq_raw.csv，bapq_recode.csv，fhi_informant.csv，fhi_interviewer.csv，fhi_subject.csv，quant_dysmorph_data.csv，srs_adult.csv（依此类推等等。抱歉，评论框不会将其格式化为输出正确...）

但是，当我使用它作为merge命令的输入时，我收到一个错误：

x <- merge(cat(ls(pattern = ".csv"), sep = ","), by = "individual", all = 
TRUE)

返回：

Error in as.data.frame(y) : argument "y" is missing, with no default
7.as.data.frame(y)
6.as.data.frame(y)
5.nrow(y <- as.data.frame(y))
4.merge.data.frame(as.data.frame(x), as.data.frame(y), ...)
3.merge(as.data.frame(x), as.data.frame(y), ...)
2.merge.default(cat(ls(pattern = ".csv"), sep = ","), by = "individual", all 
= TRUE)
1.merge(cat(ls(pattern = ".csv"), sep = ","), by = "individual", all = TRUE)

提前感谢您的帮助。

Answer 1

如果需要在解决方案中使用ls（），则无法提供帮助。

但是，如果您只想合并一个完整的.csv文件夹，每个文件夹都应该通过一个公共变量合并在一起，那么您可以这样做：

setwd('Drive:/Folder/Subfolder')

fnms<-subset(dir(),substr(dir(),nchar(dir())-3,nchar(dir()))=='.csv')

x<-read.csv(fnms[1])

  for (i in 2:length(fnms)){
temp<-read.csv(fnms[i])
  x <- merge(x,temp, by = "individual", ###or whatever variable you're merging on

all = TRUE)
    }

使用ls（）作为输入来合并R中的csv文件

1 个答案: