将功能应用于Pandas Groupby

时间:2017-08-03 20:01:02

标签: python pandas apply moving-average pandas-groupby

我目前正在使用Python中的面板数据,而我正试图计算给定组(ID)中每个时间序列观察的滚动平均值。

考虑到我的数据集的大小(数千个具有多个时间段的组),.groupby和.apply()函数的计算时间太长(已经运行了一个多小时但仍然没有 - 整个数据集只包含大约300k观测值。)

我最终想要遍历多个列,执行以下操作:

  1. 根据组ID
  2. 计算给定列中每个时间步的滚动平均值
  3. 创建一个新列,其中包含原始值与移动平均线之间的差异[x_t - (x_t-1 + x_t)/ 2]
  4. 将列存储在新的DataFrame中,该列与原始数据集相同,只是它具有#2的残差而不是原始值。
  5. 重复并将新残差附加到df_resid(如下所示)

    df_resid
    date        id   rev_resid   exp_resid
    2005-09-01   1         NaN         NaN
    2005-12-01   1      -10000       -5500
    2006-03-01   1     -352584   -262058.5
    2006-06-01   1      240000    190049.5 
    2006-09-01   1    82648.75    37724.25
    2005-09-01   2         NaN         NaN
    2005-12-01   2      4206.5       24353
    2006-03-01   2     -302574     -331951
    2006-06-01   2      103179    117405.5
    2006-09-01   2      -52650    -72296.5
    
  6. 这是原始数据的小样本。

    df
    date        id        rev        exp
    2005-09-01   1   745168.0   545168.0    
    2005-12-01   1   725168.0   534168.0    
    2006-03-01   1    20000.0    10051.0
    2006-06-01   1   500000.0   390150.0
    2006-09-01   1   665297.5   465598.5
    2005-09-01   2   956884.0   736987.0
    2005-12-01   2   965297.0   785693.0
    2006-03-01   2   360149.0   121791.0
    2006-06-01   2   566507.0   356602.0
    2006-09-01   2   461207.0   212009.0
    

    (非常慢)代码:

    df['rev_resid'] = df.groupby('id')['rev'].apply(lambda x:x.rolling(center=False,window=2).mean()) 
    

    我希望有更多计算效率的方法(主要是关于#1),并且可以扩展到多个列。

    任何帮助都会得到真正的赞赏。

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

要加快计算速度,如果数据框已经在'id'上排序,那么您不必在rollinggroupby(如果它没有排序......)这样做)。然后,因为你的窗口只有2长度,所以我们通过检查id == id.shift这在哪里工作来掩盖结果,因为它已经排序了。

d1 = df[['rev', 'exp']]
df.join(
    d1.rolling(2).mean().rsub(d1).add_suffix('_resid')[df.id.eq(df.id.shift())]
)

         date  id       rev       exp  rev_resid  exp_resid
0  2005-09-01   1  745168.0  545168.0        NaN        NaN
1  2005-12-01   1  725168.0  534168.0  -10000.00   -5500.00
2  2006-03-01   1   20000.0   10051.0 -352584.00 -262058.50
3  2006-06-01   1  500000.0  390150.0  240000.00  190049.50
4  2006-09-01   1  665297.5  465598.5   82648.75   37724.25
5  2005-09-01   2  956884.0  736987.0        NaN        NaN
6  2005-12-01   2  965297.0  785693.0    4206.50   24353.00
7  2006-03-01   2  360149.0  121791.0 -302574.00 -331951.00
8  2006-06-01   2  566507.0  356602.0  103179.00  117405.50
9  2006-09-01   2  461207.0  212009.0  -52650.00  -72296.50