我目前正在使用Python中的面板数据,而我正试图计算给定组(ID)中每个时间序列观察的滚动平均值。
考虑到我的数据集的大小(数千个具有多个时间段的组),.groupby和.apply()函数的计算时间太长(已经运行了一个多小时但仍然没有 - 整个数据集只包含大约300k观测值。)
我最终想要遍历多个列,执行以下操作:
重复并将新残差附加到df_resid(如下所示)
df_resid
date id rev_resid exp_resid
2005-09-01 1 NaN NaN
2005-12-01 1 -10000 -5500
2006-03-01 1 -352584 -262058.5
2006-06-01 1 240000 190049.5
2006-09-01 1 82648.75 37724.25
2005-09-01 2 NaN NaN
2005-12-01 2 4206.5 24353
2006-03-01 2 -302574 -331951
2006-06-01 2 103179 117405.5
2006-09-01 2 -52650 -72296.5
这是原始数据的小样本。
df
date id rev exp
2005-09-01 1 745168.0 545168.0
2005-12-01 1 725168.0 534168.0
2006-03-01 1 20000.0 10051.0
2006-06-01 1 500000.0 390150.0
2006-09-01 1 665297.5 465598.5
2005-09-01 2 956884.0 736987.0
2005-12-01 2 965297.0 785693.0
2006-03-01 2 360149.0 121791.0
2006-06-01 2 566507.0 356602.0
2006-09-01 2 461207.0 212009.0
(非常慢)代码:
df['rev_resid'] = df.groupby('id')['rev'].apply(lambda x:x.rolling(center=False,window=2).mean())
我希望有更多计算效率的方法(主要是关于#1),并且可以扩展到多个列。
任何帮助都会得到真正的赞赏。
答案 0 :(得分:2)
要加快计算速度,如果数据框已经在'id'
上排序,那么您不必在rolling
内groupby
(如果它没有排序......)这样做)。然后,因为你的窗口只有2
长度,所以我们通过检查id == id.shift
这在哪里工作来掩盖结果,因为它已经排序了。
d1 = df[['rev', 'exp']]
df.join(
d1.rolling(2).mean().rsub(d1).add_suffix('_resid')[df.id.eq(df.id.shift())]
)
date id rev exp rev_resid exp_resid
0 2005-09-01 1 745168.0 545168.0 NaN NaN
1 2005-12-01 1 725168.0 534168.0 -10000.00 -5500.00
2 2006-03-01 1 20000.0 10051.0 -352584.00 -262058.50
3 2006-06-01 1 500000.0 390150.0 240000.00 190049.50
4 2006-09-01 1 665297.5 465598.5 82648.75 37724.25
5 2005-09-01 2 956884.0 736987.0 NaN NaN
6 2005-12-01 2 965297.0 785693.0 4206.50 24353.00
7 2006-03-01 2 360149.0 121791.0 -302574.00 -331951.00
8 2006-06-01 2 566507.0 356602.0 103179.00 117405.50
9 2006-09-01 2 461207.0 212009.0 -52650.00 -72296.50