R中的strsplit函数用于data.table

Question

我有一个表格，其中一个我的列（mydata $ Gene）有一些ID，其格式为：

ENSG00000000419.8
ENSG00000000460.12

我希望了解如何使用strsplit函数删除.xx部分

所以我希望我的所有输出都是

ENSG00000000419
ENSG00000000460

等

到目前为止，我尝试了以下代码：

strsplit(mydata$Gene, ".", fixed=TRUE)

但得到错误：

  

strsplit错误（mydata $ Gene，＆＃34;。＆＃34;，fixed = TRUE）：非字符   参数

以及

strsplit(mydata$Gene, "\.", fixed=TRUE)

  

错误：＆＃39;。＆＃39;是字符串开始时无法识别的转义   ＆＃34;＆＃34;＆＃34;

有什么建议吗？

谢谢你的时间。

Answer 1

这很有效，因为您的数据看起来像是一个因素：

This only works with a Java VM of version 1.6 or higher

但如果您想要的只是点之前的文字，那么您可以通过替换替代品做得更好：

> strsplit(as.character(mydata$Gene), ".", fixed=TRUE)
[[1]]
[1] "ENSG00000000419" "8"              

[[2]]
[1] "ENSG00000000460" "12"