如何从R中的GLM中删除相关变量

时间:2017-08-02 16:41:21

标签: r glm combn

我试图从GLModel中排除相关变量。首先,我计算相关矩阵。之后,我想以某种方式将其实现为combn函数,以排除相关的变量(列标题)。此时我失败了 - 我无法将其合并到combn函数中,以便它可以工作并且相关变量被排除在外。

以下是我使用的数据的链接: https://drive.google.com/open?id=0B5IgiR_svnKcZkxHeTJXTm9jUjQ

以下是我尝试使其运行的代码:

## rm(list = ls())  ## Edited out to prevent accidents

mod_data <- read.csv("mod_data.csv", header = T)

mod_headers <- names(mod_data[3:ncol(mod_data)-1])

CM = which(abs(cor(mod_data[,1:ncol(mod_data)-1])-diag(1,ncol(mod_data)-1)) > 0.5, arr.ind = T)

f <- function(){

  null_model <- glm(newcol ~ 1, data=mod_data, family = binomial(link = "logit"), control = list(maxit = 50))
  best_model <- null_model
  best_aic <- AIC(null_model)

  for(i in 1:length(mod_headers)){
    tab <- combn(mod_headers,i)
    for(j in 1:ncol(tab)){
      tab_new <- c(tab[,j])
      mod_tab_new <- c(tab_new, "newcol")
      model <- glm(newcol ~., data=mod_data[c(mod_tab_new)], family = binomial(link = "logit"), control = list(maxit = 50000))
      if(AIC(model) < best_aic){
        best_model <- model
        best_aic <- AIC(model)
      }
    }
  }
  return(best_model)
}

f()

感谢您的提示!

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