如何使用R

Question

我像ggplot2一样制作散点图

example

但我想为点的密度着色，我尝试添加alpha值，但它不能很好地指示密度。那么如何根据重量点对重叠点进行着色？

我使用的数据看起来像这样包含10万个数字（范围从0到1）（第一列是x，第二列是y）：

0.07    0.04
0.02    0.12
0.00    0.03
0.14    0.10

我添加了alpha值，情节如下：+alpha

代码：

library(ggplot2)
p<-ggplot(file, aes(X1,X2)) + geom_point(size=1,alpha = 0.1)
p+labs(x= " " ,y=" ",title=" ") + xlim(0.0,1.0)+ ylim(0.0,1.0)

Answer 1

为了传达密度信息，点图或散点图可能不是最理想的，因为alpha很难识别。

在您的案例中查看十六进制图（http://ggplot2.tidyverse.org/reference/geom_hex.html）或热图（http://ggplot2.tidyverse.org/reference/geom_bin2d.html）。

由于我现在没有您的数据，我将只使用ggplot2个钻石数据集。您可以像这样创建上述图（两个示例都来自文档）：

library(ggplot2)
ggplot(diamonds, aes(carat, price)) +
 geom_hex()

或者像这样

library(ggplot2)
ggplot(diamonds, aes(carat, price)) +
 geom_bin2d(bins = 100)

Answer 2

我找到了一些方法：

1）Color scatterplot points by density  这个很好用。

2）Josh O'Brien's answer这真棒！我也想知道如何呈现密度和颜色的精确值之间的关系......

3）Create smoothscatter like plots with ggplot2这两个也很好。

我不擅长编程所以我可以在互联网上找到其他人提供的一些代码：（