带有facet_grid的ggplot2中带有多个分类变量的堆积条形图

Question

我正在尝试在ggplot2中创建堆积条形图，以显示与每个分类变量对应的值的百分比。以下是我尝试使用的数据示例。

sampledf <- data.frame("Death" = rep(0:1, each = 5), 
                   "HabitA" = rep(0:1, c(3, 7)),
                   "HabitB" = rep(1:2, c(4, 6)),
                   "HabitC" = rep(0:1, c(6, 4)))

每个习惯都是我用来创建堆积条形图的列，我想在facet_grid中使用Death列。我希望在条形图中显示每种习惯的值百分比。

我认为我需要创建图表的输出数据应转换为，在Death = 0下，HabitA有60％0值，40％的值为1，而在Death = 1，100％HabitA值是1.

我使用ggplot和group_by生成了这样的图表，只汇总了一个属性，但我不确定这对数据中的多个分类属性有何用处。

sampledf %>% 
  group_by(Death, HabitA) %>% 
  summarise(count=n()) %>% 
  mutate(perc=count/sum(count))

这只产生了我想要的一个变量，但是当我在group by参数中包含另一个属性时，它会返回所有3个属性的组合的百分比，这不是我想要的。我尝试使用summarise_at / mutate_at但它似乎没有工作。

sampledf %>% 
  group_by(Death) %>% 
  mutate_at(c("HabitA", "HabitB"), Counts = n())

在R中有一种直接的方法吗，并使用结果数据作为ggplot2的输入？

修改

我尝试重塑数据并使用长格式来构建我的情节。这就是我所拥有的。

long <- melt(sampledf, id.vars = c("Death"))

结果数据采用这种格式。

  Death variable value
1     0   HabitA     0
2     0   HabitA     0
3     0   HabitA     0
4     0   HabitA     1
5     0   HabitA     1
6     1   HabitA     1
7     1   HabitA     1

我不确定如何使用value属性来构建绘图，因为我当前正在尝试构建的ggplot计算variable列中每个级别出现的总次数

ggplot(long, aes(x = variable, fill = variable)) +
  geom_bar(stat = "count", position = "dodge") + facet_grid(~ Death)

Answer 1

试试这个，也许不是那么简单，但它有效。它包括由gather建议的@aosmith重塑。然后计算分组后的观察次数，然后计算每个群组的百分比Death + habitat。然后总结以获得独特的价值。

sampledf_edited <- sampledf %>% 
  tidyr::gather("habitat", "count", 2:4) %>% 
  group_by(Death, habitat, count) %>% 
  mutate(observation = n()) %>% 
  ungroup() %>% 
  group_by(Death, habitat) %>% 
  mutate(percent = observation/n()) %>% 
  ungroup() %>% 
  group_by(Death, habitat, count, percent) %>%
  summarize()

必须制作count因素。

sampledf_edited$count <- as.factor(sampledf_edited$count)

按ggplot绘图。

ggplot(sampledf_edited, aes(habitat, percent, fill = count)) +  
geom_bar(stat = "identity") + 
facet_grid(~ Death)

如果您的问题已得到解答，请务必接受答复以供进一步参考。

--- --- EDIT 情节补充