ggplot和plot如何处理inf值的方式不同?

时间:2017-07-24 01:31:45

标签: r plot ggplot2

我很难理解为什么ggplotplot会产生略微不同的相同数据图。 ggplot包含inf值,而plot则不包括。

with(geneFDR, plot(log2(FC), -log10(FDR), pch=20, main="FDR vs. Real FC",
col=geneFDR$FDRColor))

enter image description here

ggplot(data=geneFDR, aes(x=log2(FC), y=-log10(FDR), color=FDRFCthreshold)) +
  geom_point(alpha=0.4, size=1.75) +
  ggtitle("FDR vs. Real Fold Change") +
  xlab("log2 Real Fold Change") + ylab("-log10(FDR)")

enter image description here

inf值的来源:

min(geneFDR$FDR)
[1] 0
max(geneFDR$FDR)
[1] 0.009883703

min(-log10(geneFDR$FDR))
[1] 2.00508
max(-log10(geneFDR$FDR))
[1] Inf

默认plot函数处理inf值的方式与ggplot不同?

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scale_y_continuous(oob=scales::discard)