我在并行分配我的功能时遇到了问题。
问题陈述:我有2个坐标对列表,dfC
和dfO
。对于dfC
中的每个障碍,我计算了dfO
在半径范围内r
落入的数量dfC
。 我目前有一个工作功能,但我试图看看我是否可以并行处理。
问题是:dfO
可以单独拆分和处理......但每个工作人员dfO
需要100%。我的方法是,让我先让这个并行工作 - 然后我会担心如何向工人分发import pandas as pd
import numpy as np
import multiprocessing as mp
from multiprocessing import Pool, process
import traceback
from scipy.spatial import cKDTree
# create 2 dataframes with random "coordinates"
dfC=pd.DataFrame(np.random.np.random.randint(0,100,size=(50,2)), columns=list('xy'))
dfO=pd.DataFrame(np.random.np.random.randint(0,100,size=(500,2)), columns=list('jk'))
的完整副本。除非有人能帮我解决这两个问题吗?
首先,这里是设置所有内容的代码:
dfC
以下是dfO
的示例,+----+----+
| x | y |
+----+----+
| 35 | 5 |
+----+----+
| 96 | 18 |
+----+----+
| 23 | 25 |
+----+----+
| 20 | 7 |
+----+----+
| 74 | 54 |
+----+----+
看起来很相似
# this function works on dfC, and adds a row which counts the number
# of objects in dfO which are within radius r
def worker_job(args):
try:
dfC, dfO, newcol, r = args
mxC=dfC.as_matrix()
mxO = dfO.as_matrix()
# magic tree stuff
C_Tree = cKDTree(mxC)
O_Tree = cKDTree(mxO)
listoflists = C_Tree.query_ball_tree(O_Tree, r, p=2.0, eps=0.0)
counts=[]
for i in listoflists:
counts.append(len(i))
s = pd.Series(counts)
dfC[newcol] = s.values
except:
raise
traceback.print_exc()
else:
return dfC
接下来,这里的功能就像魅力一样。我没有单独传递所有参数,而是故意这样做 - 准备一个主函数来并行调用它们(我无法找到一种方法来进行多处理) )。
args=[dfC,dfO,"new_column_name",3]
如果我创建这样的参数:
worker_job(args)
当我自己运行它时它完美地工作:
+----+----+-----------------+
| x | y | new_column_name |
+----+----+-----------------+
| 35 | 5 | 4 |
+----+----+-----------------+
| 96 | 18 | 1 |
+----+----+-----------------+
| 23 | 25 | 0 |
+----+----+-----------------+
| 20 | 7 | 1 |
+----+----+-----------------+
| 74 | 54 | 2 |
+----+----+-----------------+
# this function should control the multiprocessing
def Run_Parallel(Function, Num_Proc, args):
try:
pool = Pool(Num_Proc)
parts = pool.map(Function,args)
pool.close()
pool.join()
results_df = pd.concat(parts)
except:
pool.close()
pool.terminate()
traceback.print_exc()
else:
return results_df
现在,我尝试构建将控制并行工作程序并并行运行此函数的函数。这是我最大的努力:
Run_Parallel(worker_job,2,args)
它不会起作用。 ValueError: not enough values to unpack (expected 4, got 2)
引发了有关dfO
的错误。当它通过包装器时,必须在参数列表中发生一些事情。
我正在寻找有关此错误的指导,以及任何知道如何解决更大问题的人的奖励积分 - 这是我需要我的池包含100%的dfC
而只是一个子集mylist = [[[1,2],[3,4]],[[8,9],[7,7]]]
[[max(y[0] for y in x), min(y[1] for y in x)] for x in mylist]
为了提高效率。
答案 0 :(得分:1)
答案是将参数作为列表列表传递。这也解决了分割数据帧的另一个问题(我认为池默认处理这个问题,但事实并非如此)。
正确的功能应如下所示:
# this function should control the multiprocessing
def Run_Parallel(Function, Num_Proc, args):
dfC, dfO, newcol, r = args
# to make lists of lists
argslist=[]
dfOlist=[]
dfClist=[]
resultlist=[]
# split dfC into parts
Cparts=np.array_split(dfC, Num_Proc)
# build the lists
for i in range(Num_Proc):
argslist.append([Cparts[i],dfO,newcol,r])
try:
pool = Pool(Num_Proc)
parts = pool.map(Function,argslist)
pool.close()
pool.join()
results_df = pd.concat(parts)
except:
pool.close()
pool.terminate()
traceback.print_exc()
else:
return results_df