深层嵌套JSON对pandas dataframe

时间:2017-07-18 13:41:03

标签: python json pandas nested resultset

我是python / pandas的新手,我在将嵌套JSON转换为pandas数据帧时遇到了一些问题。我正在向数据库发送查询并返回JSON字符串。

它是一个包含多个数组的深层嵌套JSON字符串。数据库的响应包含数千行。以下是JSON字符串中一行的一般结构:

{
  "ID": "123456",
  "profile": {
    "criteria": [
      {
        "type": "type1",
        "name": "name1",
        "value": "7",
        "properties": []
      },
      {
        "type": "type2",
        "name": "name2",
        "value": "6",
        "properties": [
          {
            "type": "MAX",
            "name": "",
            "value": "100"
          },
          {
            "type": "MIN",
            "name": "",
            "value": "5"
          }
        ]
      },
      {
        "type": "type3",
        "name": "name3",
        "value": "5",
        "properties": []
      }
    ]
  }
}  
{
  "ID": "456789",
  "profile": {
    "criteria": [
      {
        "type": "type4",
        "name": "name4",
        "value": "6",
        "properties": []
      }
    ]
  }
}

我想使用python pandas压扁这个JSON字符串。我在使用json_normalize时遇到了问题,因为这是一个深度嵌套的JSON字符串:

from cassandra.cluster import Cluster
import pandas as pd
from pandas.io.json import json_normalize

def pandas_factory(colnames, rows):
    return pd.DataFrame(rows, columns=colnames)

cluster = Cluster(['xxx.xx.x.xx'], port=yyyy)
session = cluster.connect('nnnn')

session.row_factory = pandas_factory

json_string = session.execute('select json ......')
df = json_string ._current_rows
df_normalized= json_normalize(df)
print(df_normalized)

当我运行此代码时,我收到一个Key错误:

KeyError: 0

我需要帮助将此JSON字符串转换为只包含一些选定列的数据框,如下所示:(可以跳过其余数据)

ID        |   criteria   | type   |   name   |   value   |

123456          1          type1      name1        7      
123456          2          type2      name2        6  
123456          3          type3      name3        5    
456789          1          type4      name4        6

我试图在这里找到类似的问题,但我似乎无法将它应用于我的JSON字符串。

任何帮助表示赞赏! :)

修改

被撤消的json字符串是查询响应对象:ResultSet 。我认为这就是为什么我在使用中遇到一些问题:

json_string= session.execute('select json profile from visning')
temp = json.loads(json_string)

并收到错误:

TypeError: the JSON object must be str, not 'ResultSet'

编辑#2:

为了了解我正在使用的内容,我使用以下方法打印了结果查询:

for line in session.execute('select json.....'):
    print(line)

得到这样的东西:

Row(json='{"ID": null, "profile": null}')
Row(json='{"ID": "123", "profile": {"criteria": [{"type": "type1", "name": "name1", "value": "10", "properties": []}, {"type": "type2", "name": "name2", "value": "50", "properties": []}, {"type": "type3", "name": "name3", "value": "40", "properties": []}]}}')
Row(json='{"ID": "456", "profile": {"criteria": []}}')
Row(json='{"ID": "789", "profile": {"criteria": [{"type": "type4", "name": "name4", "value": "5", "properties": []}]}}')
Row(json='{"ID": "987", "profile": {"criteria": [{"type": "type5", "name": "name5", "value": "70", "properties": []}, {"type": "type6", "name": "name6", "value": "60", "properties": []}, {"type": "type7", "name": "name7", "value": "2", "properties": []}, {"type": "type8", "name": "name8", "value": "7", "properties": []}]}}')

我遇到的问题是将此结构转换为可在json.loads()中使用的json字符串:

json_string= session.execute('select json profile from visning')
json_list = list(json_string)
string= ''.join(list(map(str, json_list)))
temp = json.loads(string) <-- creates error json.decoder.JSONDecodeError: Expecting value: line 1 column 1 (char 0)

编辑#3:

根据评论中的要求,打印

for line in session.execute('select json.....'):
print((line.json))

得到输出:

{"ID": null, "profile": null}
{"ID": "123", "profile": {"criteria": [{"type": "type1", "name": "name1", "value": "10", "properties": []}, {"type": "type2", "name": "name2", "value": "50", "properties": []}, {"type": "type3", "name": "name3", "value": "40", "properties": []}]}}
{"ID": "456", "profile": {"criteria": []}}
{"ID": "789", "profile": {"criteria": [{"type": "type4", "name": "name4", "value": "5", "properties": []}]}}
{"ID": "987", "profile": {"criteria": [{"type": "type5", "name": "name5", "value": "70", "properties": []}, {"type": "type6", "name": "name6", "value": "60", "properties": []}, {"type": "type7", "name": "name7", "value": "2", "properties": []}, {"type": "type8", "name": "name8", "value": "7", "properties": []}]}}

1 个答案:

答案 0 :(得分:2)

一个硬编码的例子......

import pandas as pd

temp = [{
  "ID": "123456",
  "profile": {
    "criteria": [
      {
        "type": "type1",
        "name": "name1",
        "value": "7",
        "properties": []
      },
      {
        "type": "type2",
        "name": "name2",
        "value": "6",
        "properties": [
          {
            "type": "MAX",
            "name": "",
            "value": "100"
          },
          {
            "type": "MIN",
            "name": "",
            "value": "5"
          }
        ]
      },
      {
        "type": "type3",
        "name": "name3",
        "value": "5",
        "properties": []
      }
    ]
  }
},
{
  "ID": "456789",
  "profile": {
    "criteria": [
      {
        "type": "type4",
        "name": "name4",
        "value": "6",
        "properties": []
      }
    ]
  }
}]

cols = ['ID', 'criteria', 'type', 'name', 'value']

rows = []
for data in temp:
    data_id = data['ID']
    criteria = data['profile']['criteria']
    for d in criteria:
        rows.append([data_id, criteria.index(d)+1, *list(d.values())[:-1]])

df = pd.DataFrame(rows, columns=cols)

这绝不是优雅的。它更像是一个快速而肮脏的解决方案,因为我不知道JSON数据是如何准确格式化的 - 但是,根据您提供的内容,我上面的代码将生成所需的DataFrame。

       ID  criteria   type   name value
0  123456         1  type1  name1     7
1  123456         2  type2  name2     6
2  123456         3  type3  name3     5
3  456789         1  type4  name4     6

此外,如果您需要加载&#39;在JSON数据中,您可以使用json库,如下所示:

import json

temp = json.loads(json_string)

# Or from a file...
with open('some_json.json') as json_file:
    temp = json.load(json_file)

请注意json.loadsjson.load之间的区别。