特定染色体靶标的重复循环

Question

我是新手，所以欢迎任何建议。

我在数据框中有三列，一列显示染色体位置，接下来两列显示染色体位置的开始和结束（即chr1 1100 1200）。

前十行显示chr1的数据，但之后有chr2的数据，依此类推。

我创建了一个循环，我只想将它应用于chr1行。然后我想为chr2重复相同的事情。

到目前为止，我已经编写了以下似乎不起作用的内容：for（i in data.frame $ chr1）。

还有其他建议吗？

由于

Answer 1

您可以使用split功能。它将沿染色体变量分开，您可以使用sapply或lapply函数迭代每个列表元素（现在保存单个染色体的数据）。如果您提供可重现的示例，则显示如何实现此功能非常简单。