Question

我有2个netCDF文件（每个.nc文件有4个变量：易感，感染，恢复和居住。每个变量的尺寸为64 x 88）。我想将这两个文件合并到一个netCDF文件中，以便合并的文件将分别堆叠，从2个文件中感染，从2个文件中感染，从2个文件恢复，从2个文件中恢复。

以下是2个文件（first和second）

有人可以帮我这个吗？

提前致谢，阿肖克

Answer 1

ncdf4包将执行您想要执行的操作。看看下面的代码，仅针对一个变量的示例。

#install.packages('ncdf4')
library(ncdf4)

file1 <- nc_open('England_aggr_GPW4_2000_0001.nc')
file2 <- nc_open('England_aggr_GPW4_2000_0002.nc')

# Just for one variable for now
dat_new <- cbind(
  ncvar_get(file1, 'Susceptible'),
  ncvar_get(file2, 'Susceptible'))
dim(dat_new)
var <- file1$var['Susceptible']$Susceptible

# Create a new file
file_new3 <- nc_create(
  filename = 'England_aggr_GPW4_2000_new.nc', 
  # We need to define the variables here
  vars = ncvar_def(
    name = 'Susceptible',
    units = var$units,
    dim = dim(dat_new)))

# And write to it
ncvar_put(
  nc = file_new,
  varid = 'Susceptible',
  vals = dat_new)

# Finally, close the file
nc_close(file_new)

<强>更新另一种方法是使用光栅包，如下所示。我没有弄清楚如何制作4D光栅堆栈，因此我将每个变量的数据拆分为一个NCDF文件。这对你有用吗？

#install.packages('ncdf4')
library(ncdf4)
library(raster)

var_names <- c('Susceptible', 'Infected', 'Recovered', 'Inhabitable')

for (var_name in var_names) {

  # Create raster stack
  x <- stack(
    raster('England_aggr_GPW4_2000_0001.nc', varname = var_name),
    raster('England_aggr_GPW4_2000_0002.nc', varname = var_name))

  # Name each layer
  names(x) <- c('01', '02') 

  writeRaster(x = x, 
              filename = paste0(var_name, '_out.nc'),
              overwrite = TRUE, 
              format = 'CDF')
}

在R

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