R gzfile输出不完整

Question

我试图从R中的data.frame获取gz输出 我使用了以下脚本：

write.table(res,file = gzfile(newfile,open="wb"),quote = FALSE,sep="\t",row.names = FALSE,col.names = FALSE)

但输出不完整。 但是，如果我不使用gzfile（），输出就可以了。例如：

write.table(res,file =newfile,quote = FALSE,sep="\t",row.names = FALSE,col.names = FALSE)

输出不大，gz格式只有9 MB。我在互联网上找不到原因。我想知道为什么会这样。 谢谢！

Answer 1

您正在创建连接并打开它，但您永远不会关闭它。在关闭之前它不会完整。

有两种解决方案：

不要打开连接，让write.table(res,file = gzfile(newfile),quote = FALSE,sep="\t",row.names = FALSE,col.names = FALSE) 打开它：

con <- gzfile(newfile, "wb")
write.table(res,file = con,quote = FALSE,sep="\t",row.names = FALSE,col.names = FALSE)
close(con)

或者，将其保存在变量中，然后明确地将其关闭：

loop