我在使用带有R的iGraph软件包时遇到了一些麻烦。特别是当我试图将所有节点与给定节点分开2度时,然后使用该列表运行某些操作通过功能。
我对R中的列表工作方式并不十分自信,更不用说iGraph.vs类了。
理想情况下,我希望使用ego
到第二度Listnode_test <- (ego(Graph1, 2, "accumsan"))
生成顶点列表。这将返回Listnode_test
。这是输出:
structure(list(structure(c(1L, 3L, 5L, 9L, 10L, 11L, 16L, 24L,
1 c(1, 3, 5, 9, 10, 11, 16, 24, 32, 59, 64, 2, 4, 6, 14, 15, 1
问题在于我希望它在理想情况下只返回一个显示"node1, node2, node3"
等列表的节点列表。这样我就可以通过这样的函数运行它们了:
for (i in 1:length(Listnode_test[[1]]))
{
Perspective <- 1
Listnode <- neighborhood.size(Graph1, 1, Listnode_test[[1]][i], mode="in")
##a save script either to a DF or global env
}
基本上我想获得一个节点,然后获得在X度分离内连接到它的每个节点的列表。在我生成此列表后,我想将其提供给函数,该函数计算所提供列表中每个节点的入度。
非常感谢任何帮助。我在下面提供了顶点DF的示例:
> vertices
from to query
1 accumsan a Benefit
2 nonummy a Benefit
3 mollis a Benefit
4 velit a Benefit
5 et a Benefit
6 vulputate a Benefit
7 magna a Benefit
8 et a Risk
9 feugiat ac Benefit
10 feugiat ac Sequential
11 mollis accumsan Benefit
12 a accumsan Benefit
13 mauris accumsan Benefit
14 et accumsan Benefit
15 fermentum accumsan Other
16 mollis accumsan Scope
答案 0 :(得分:2)
好的,所以我现在已经想出了如何做到这一点。
node.list <- Listnode_test[[1]][i]
> node.list
+ 1/68 vertex, named:
[1] vel
node.list <- as_ids(node.list)
> as_ids(node.list)
[1] "vel"
> node.list <- as_ids(node.list)
> df <- data.frame (node.list, in.degree, perspective)
> df
node.list in.degree perspective
1 vel 2 1
iGraph中的as_ids()
函数将iGraph.vs转换为矢量:)