Question

我正在尝试使用awk提取部分模式和完全匹配。部分模式为gene analysis,，完全匹配为common variant。提取第1行是因为它具有这两个标准。第4行不是因为它不包含完全匹配。谢谢你:)。

AWK

awk -F'\t' -v OFS="\t" '$2 ~ /^gene analysis,("common variant")$/' file

档案 tab-delimeted

123 this is for gene analysis, common variant
456 xxxx
789 yyyy
111 gene analysis, deletion

所需的输出 tab-delimited

123 this is for gene analysis, common variant

Answer 1

我的理解是你正在寻找与基因分析，常见变体和＃34;的完全匹配。字符串，不需要拆分字符串以匹配部分

library(dplyr)
library(zoo)


time.a = as.Date(c(10:30))
time.b = as.Date(c(20:40))
time.c = as.Date(c(30:50))

value.a = as.numeric(seq(10,30,1))
value.b = as.numeric(seq(20,60,2))
value.c = as.numeric(seq(20,30,.5))

    length(time.a)
    length(time.b)
    length(time.c)

    length(value.a)
    length(value.b)
    length(value.c)


    print(time.a)
    print(time.b)
    print(time.c)

    print(value.a)
    print(value.b)
    print(value.c)



data.a = data.frame(time.a, value.a)
data.b = data.frame(time.b, value.b)
data.c = data.frame(time.c, value.c)

names(data.a) = c("Date", "Value.a")
names(data.b) = c("Date", "Value.b")
names(data.c) = c("Date", "Value.c")

all.data = full_join(data.a, data.b)
all.data = full_join(all.data, data.c)


plot(all.data$Date, all.data$Value.a,
     type = "l",
     main = "plot",
     xlab = "Date",
     ylab = "Values")

lines(all.data$Date, all.data$Value.b,
      col = "blue")


lines(all.data$Date, all.data$Value.c,
      col = "red")

awk提取部分匹配到相同行上的模式和完全匹配

1 个答案: