Question

我的数据框如下所示：

input <- structure(list(rank = c(1L, 2L, 3L, 3L, 4L, 4L, 5L, 5L, 6L, 6L, 
7L, 7L, 8L, 8L, 9L, 10L, 11L, 11L, 11L, 11L, 12L, 12L, 13L, 14L, 
14L, 15L, 16L, 17L, 18L, 19L), sequence = c("HRIGRGGRYGRKGVAI", 
"TQIDELPVDFAAYLGE", "AFSIGLLQRLDFRHNL", "QNDKIAPQDQDSFLDD", "SMHAEMPKSDRERVMN", 
"AQSVIFANTRRKVDWI", "PGRVSDVIKRGALRTE", "AEVISRIGEFLSNSSK", "GGDIIAQAQSGTGKTG", 
"TFVGGTRVQDDLRKLQ", "QGLVLSPTRELALQTA", "DWIAEKLNQSNHTVSS", "NIVINFDLPTNKENYL", 
"AGVIVAVGTPGRVSDV", "SDRERVMNTFRSGSSR", "GFEKPSSIQQRAIAPF", "SGTGKTGAFSIGLLQR", 
"LDTLMDLYETVSIAQS", "VRPIPSFDDMPLHQNL", "MPEEVLELTKKFMRDP", "QQRAIAPFTRGGDIIA", 
"LHEIEAHYHTQIDELP", "LVARGIDVHHVNIVIN", "ANTRRKVDWIAEKLNQ", "VLVLDEADEMLSQGFA", 
"RGALRTESLRVLVLDE", "PQDQDSFLDDQPGVRP", "YGRKGVAINFVTEKDV", "SSKFCETFVGGTRVQD", 
"RVLVTTDLVARGIDVH"), start_position = c(353L, 388L, 79L, 3L, 
296L, 268L, 155L, 111L, 63L, 130L, 96L, 281L, 337L, 146L, 304L, 
45L, 72L, 255L, 22L, 212L, 53L, 379L, 326L, 274L, 174L, 164L, 
9L, 361L, 124L, 319L), score = c(0.92, 0.89, 0.87, 0.87, 0.86, 
0.86, 0.85, 0.85, 0.84, 0.84, 0.79, 0.79, 0.78, 0.78, 0.77, 0.76, 
0.75, 0.75, 0.75, 0.75, 0.74, 0.74, 0.73, 0.72, 0.72, 0.71, 0.68, 
0.67, 0.65, 0.63)), .Names = c("rank", "sequence", "start_position", 
"score"), row.names = c(NA, -30L), class = c("tbl_df", "tbl", 
"data.frame"))

我想做的是以下内容。查看input$rank，我想将input$score下的分数相加，直到input$rank下的序列为止。

作为一个例子，考虑第一个序列，它来自行 1:36（input$rank下的第37个值是1 - 注意在{{1下有重复值] }），我的总和是26.76 - 我通过input$rank得到了这个。

我考虑在sum(input$score[1:36])或break循环中插入next或for，但我并不熟悉循环中的那些参数。

Answer 1

aggregate(input[c(1,4)],by=list(input$rank),sum)

这是你想要的吗？

Answer 2

希望这更接近你正在寻找的东西。我所做的是测试小于零的值的等级向量的差异版本并对其进行累积求和。然后将结果用作对aggregate()的调用中的分组向量。

set.seed(1)
rank <- c(1, 2, 3, 5, 5, 1, 2, 2, 3, 1, 2, 4, 4, 5)
score <- round(runif(length(rank)), 2)
input <- data.frame(rank, score)
input <- cbind(group=cumsum(c(-1, diff(input$rank)) < 0), input)
input
#    group rank score
# 1      1    1  0.27
# 2      1    2  0.37
# 3      1    3  0.57
# 4      1    5  0.91
# 5      1    5  0.20
# 6      2    1  0.90
# 7      2    2  0.94
# 8      2    2  0.66
# 9      2    3  0.63
# 10     3    1  0.06
# 11     3    2  0.21
# 12     3    4  0.18
# 13     3    4  0.69
# 14     3    5  0.38

aggregate(score ~ group, data=input, sum)
#   group score
# 1     1  2.32
# 2     2  3.13
# 3     3  1.52

for / while循环直到保持序列

2 个答案: