eigen中的错误(val,only.values = TRUE):在gls中估计lambda时,'x'中的值无限或缺失

时间:2017-06-26 13:40:08

标签: r lambda estimation

我在使用R中的gls函数估计lambda时遇到了问题。

当我运行固定值lambda(即fixed = TRUE)时,gls函数完全正常工作但是当我试图估计lambda并将lambda的这个估计结合到我的分析中时,即。 :

result = gls(traitY ~ traitX, data=DF, 
             correlation=corPagel(value=1, tree_list[[1]], fixed=FALSE), method="ML")

我总是收到以下错误消息:

Error in eigen(val, only.values = TRUE) : 
  infinite or missing values in 'x'

我的问题是:我的数据中的特征引用了什么/我的后续数据中的x是什么(数据= DF)?

DF

                    traitY    traitX               
Alouatta_palliata           0.5273489 0.6250000
Ateles_geoffroyi            0.5051398 0.4380000
Cebus_capucinus             0.2895715 0.5036667
Saimiri_sciureus            0.3591358 0.6590000
Cebus_apella                0.6884629 0.5572500
Cercopithecus_diana         0.5714286 0.9050000
Chlorocebus_pygerythrus     0.7604781 0.7246667
Erythrocebus_patas          0.0000000 1.0000000
Macaca_arctoides            0.4155720 0.5895000
Macaca_fuscata              0.6594206 0.5563333
Macaca_mulatta              0.6614815 0.8275000
Macaca_nigra                0.6416667 0.8170000
Macaca_radiata              0.7331135 0.6910000
Macaca_tonkeana             0.4991048 0.8932500
Papio_ursinus               0.7044067 0.6570000
Homo_sapiens                0.5037506 0.5320000
Pan_paniscus                0.6000000 0.9000000
Pan_troglodytes_troglodytes 0.1771352 0.8856364
Pongo_pygmaeus              0.5000000 0.6000000
Eulemur_fulvus_fulvus       0.7662338 0.8730000
Eulemur_fulvus_rufus        0.7334606 0.5475000

PS。我使用的是库:nlmeape

我会非常感谢任何建议/帮助,因为我不能解决这个特殊问题就不能继续我的分析(将估计的lambda用于我的统计解释非常重要)并且已经被困在了虽然并没有在网上找到任何有用的东西。

提前致谢, Ly的

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