将链接矩阵转换为树（scipy.cluster.hierarchy.to_tree，python3）

Question

我想将链接矩阵转换为树（将其转换为newick格式）。链接矩阵如下所示：

[[ 0.  1.  1.  2.]
[ 2.  4.  4.  3.]
[ 3.  5.  6.  4.]]

当我运行代码时（'来自ete3导入树'）：

T = scipy.cluster.hierarchy.to_tree(Z)
root = Tree()
root.dist = 0
root.name = "root"
item2node = {T: root}

程序在item2node处终止，并显示错误消息：

  

异常“未处理的TypeError”
  不可用类型：'ClusterNode'

有什么想法吗？