使用ggplot的facet_wrap和自相关图

时间:2017-06-22 11:06:48

标签: r ggplot2 data-visualization facet

我想为我的数据的不同子组创建一个ggplot自相关图。

使用forecast包,我设法生成整个样本的ggplot数字,如下所示:

library(tidyverse)
library(forecast)

df <- data.frame(val = runif(100),
                key = c(rep('a', 50), key = rep('b', 50)))

ggAcf(df$val) 

产生:

enter image description here

但是现在我正在尝试以下方法来制作方面而且它不起作用:

ggplot(df) +
  ggAcf(aes(val)) +
  facet_wrap(~key) 

有什么想法吗?

3 个答案:

答案 0 :(得分:3)

构建acf值并手动绘制的可能解决方案。

library(tidyverse)
library(forecast)

df <- data.frame(val = runif(100),
                 key = c(rep('a', 50), key = rep('b', 50)))

df_acf <- df %>% 
  group_by(key) %>% 
  summarise(list_acf=list(acf(val, plot=FALSE))) %>%
  mutate(acf_vals=purrr::map(list_acf, ~as.numeric(.x$acf))) %>% 
  select(-list_acf) %>% 
  unnest() %>% 
  group_by(key) %>% 
  mutate(lag=row_number() - 1)

df_ci <- df %>% 
  group_by(key) %>% 
  summarise(ci = qnorm((1 + 0.95)/2)/sqrt(n()))

ggplot(df_acf, aes(x=lag, y=acf_vals)) +
  geom_bar(stat="identity", width=.05) +
  geom_hline(yintercept = 0) +
  geom_hline(data = df_ci, aes(yintercept = -ci), color="blue", linetype="dotted") +
  geom_hline(data = df_ci, aes(yintercept = ci), color="blue", linetype="dotted") +
  labs(x="Lag", y="ACF") +
  facet_wrap(~key)

acf with calc ci

答案 1 :(得分:2)

library(forecast)
df <- data.frame(val = runif(100),
                 key = c(rep('a', 50), key = rep('b', 50)))


a = subset(df, key == "a")
ap = ggAcf(a$val)

b = subset(df, key == "b")
bp = ggAcf(b$val)


library(grid)
grid.newpage()
pushViewport(viewport(layout=grid.layout(1,2)))
print(ap, vp=viewport(layout.pos.row = 1, layout.pos.col = 1))
print(bp, vp=viewport(layout.pos.row = 1, layout.pos.col = 2))

enter image description here

或者:

grid.newpage()
pushViewport(viewport(layout=grid.layout(1,2)))
print(ap, vp=viewport(layout.pos.row = 1, layout.pos.col = 1))
print(bp, vp=viewport(layout.pos.row = 1, layout.pos.col = 2))

enter image description here

答案 2 :(得分:0)

亚当·斯潘鲍尔(Adam Spannbauer)的回答非常好,输出与forecast::ggAcf非常相似,可能是虚线的置信限界线不同于ggAcf产生的虚线(如果确定,这很容易解决所需)。

一种快速且可能更简单的替代方法是将ggfortify::autoplot与不同构面值的列表一起使用,如下例所示:

# Load ggfortify
require(ggfortify)

# Create sample data frame
df <- data.frame(val = runif(100),
                 key = c(rep('a', 50), key = rep('b', 50)))

# Create list with ACF objects for different key values
acf.key <- list()
for (i in 1:length(unique(df$key))) {
  acf.key[[i]] <- acf(df$val[df$key==unique(df$key)[[i]]])
}

# Plot using ggfortify::autoplot
autoplot(acf.key, ncol=2)

enter image description here

不幸的是,似乎不可能像标准ggplot那样在标绘上获得带有多面标题的标语,因此最终结果并不像上面的答案那样优美。在保留左侧图的标签的同时,我也无法删除右侧图的y轴标签。