生成错误的树状图

Question

我有31个数据，但dendrogram缺少一个数据。这是我的代码：

A = csvread('similarityNoGrpS2.csv',1,1) % 31x31 double
Z = linkage(A, 'average') % 30x3 double
H = dendrogram(Z,'Orientation','left','ColorThreshold','default') %29x1 line

我的输入文件可以找到here。

这是我的dendrogram：

根据Z，(24,30)和(27,31)应该被群集，但在dendrogram图片中，我们可以看到没有31和{{1正在与27聚集，这是错误的！

有人可以帮我解决这个问题吗？

P.S。我正在使用MATLAB R2016a。

Answer 1

您需要将代码的最后一行修改为：

H = dendrogram(Z, 0, 'Orientation', 'left', 'ColorThreshold', 'default');

对于给定的数据给出：

说明

您的 原始数据集 （A）的点数超过30但您没有指定P的值。它在documentation中提到：

  

如果未指定P，则dendrogram使用30作为叶节点的最大数量。 要显示完整的树，请将P设置为0 。

因此您需要将P=0置于此语法中：

dendrogram(tree,P,Name,Value)