Grep计算文件B中文件A的出现次数

Question

我有两个文件，文件A可能在文件B中，我想计算文件A中的每一行，它在文件B中出现的次数。例如：

档案A：

GAGGACAGACTACTAAAGCC
CTTGCCGCAGATTATCAGAG
CCAGCTTGATGTGTCCTGTG
TGATAGGCAGTGGAACACTG

档案B：

NTCTTGAGGAAAGGACGAATCTGCGGAGGACAGACTACTAAAGCCGTTTGAGAGCTAGAACGAGCAAGTTAAGAGA
TCTTGAGGAAAGGACGAAACTCCGGAGGACAGACTACTAAAGCCGTTTTAGAGCTAGAAAGCGCAAGTTAAACGAC
NTCTTGAGGAAAGGACGAATCTGCGCTTGCCGCAGATTATCAGAGGTATGAGAGCTAGAACGAGCAAGTTAAGAGC
TCTTGAGGAAAGGACGAAAGTGCGCTTGCCGCAGATTATCAGAGGTTTTAGAGCTAGAAAGAGCAAGTTAAAATAA
GATCTAGTGGAAAGGACGATTCTCCGCTTGCCGCAGATTATCAGAGGTTGTAGAGCTAGAACTAGCAAGTGACAAG
ATCTTGAGGAAAGGACGAATCTGCGCTTGCCGCAGATTATCAGAGGTTTGAGAGCTAGAACTAGCAAGTTAATAGA
CGATCAAGTGGAAGGACGATTCTCCGTGATAGGCAGTGGAACACTGGATGTAGAGCTAGAAATAGCAAGTGAGCAG
ATCTAGAGGAAAGGACGAATCTCCGTGATAGGCAGTGGAACACTGGTATGAGAGCTAGAACTAGCAAGTTAATAGA
TCTTGAGGAAAGGACGAAACTCCGTGATAGGCAGTGGAACACTGGTTTTAGAGCTAGAAAGCGCAAGTTAAAAGAC

输出应该是文件C：

2 GAGGACAGACTACTAAAGCC
4 CTTGCCGCAGATTATCAGAG
0 CCAGCTTGATGTGTCCTGTG
3 TGATAGGCAGTGGAACACTG

我想用grep这样做，我尝试了-c，o，f的一些变体，但我似乎无法获得正确的输出。

我怎样才能做到这一点？

Answer 1

试试这个

for i in `cat a`; do echo "$i  `grep $i -c b`"; done

在这种情况下，如果文件A中的行在文件B的一行中多次出现，那么这将被计为一次。如果你想计算这样的事件，但没有重叠使用这个

for i in `cat a`; do printf $i; grep $i -o b | wc -l; done

也许这个变种会更快

cat b | grep "`cat a`" -o | sort | uniq -c

Answer 2

loop = asyncio.ProactorEventLoop()
asyncio.set_event_loop(loop)

Answer 3

用于比较文件的Linux命令：

comm FileA FileB

comm生成三列输出。第一列包含FileA唯一的行，第二列包含FileB唯一的行，第三列包含两个文件共有的行。