在Trimmomatic中是否有滑动窗口的默认值？

Question

如果我给AVGQUAL命令：20没有滑动窗口，它会设置滑动窗口的任何默认值吗？

Answer 1

如果你查看了trimmmomatic网站http://www.usadellab.org/cms/?page=trimmomatic，你会在那里找到手册。

在AVGQUAL手册中说：AVGQUAL: Drop the read if the average quality is below the specified level

因此，不需要窗口，因为此步骤总结了所有质量，除以长度并检查是否达到阈值，然后删除或保留读取。