我使用FactorMineR软件包构建了一个简单的应用程序,根据所选变量进行MCA分析和聚类。
该应用程序在我的本地设备上正常工作,但它没有在shinyapps.io服务器上显示任何图表(基本图和ggplots)。我检查了包和本地和remotley它们是相同的。我还检查了FactoMineR pcg中的MCA()函数是否可以通过提取一些结果并将它们呈现为表格给出积极结果。所以只有绘图的问题。我一直试图解决它两天,但没有任何帮助,所以我问你任何建议。
以下是该应用的链接:https://mikolajm.shinyapps.io/MCA_test/
可重现的例子
library(shiny)
library(FactoMineR)
library(cluster)
library(ggplot2)
data(tea)
ui <- fluidPage(
# Application title
titlePanel("MCA"),
textOutput("packages"),br(),
tableOutput("table"),br(),
fluidRow(
column(4, checkboxGroupInput("Variables", "Select variables:",
names(tea), selected=c("breakfast", "tea.time"))),
column(4, plotOutput("plot")), column(4, plotOutput("plot1"))),
fluidRow(column(12, plotOutput("dendro", height = "700px", width="1200px"))
)
)
server <- function(input, output) {
## packages checking
output$packages <- renderText({.packages()})
tea_selected <- reactive({
tea[, input$Variables]
})
## table with some results from MCA() fun
output$table <- renderTable({
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
tea.mca$eig[1:5,]
})
## mca1
output$plot <- renderPlot({
library(FactoMineR)
par(mfrow=c(2,2))
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
})
## mca with ggplot
output$plot1 <- renderPlot({
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
tea_vars_df <- data.frame(tea.mca$var$eta2, Variable =names(tea_selected()))
library(ggplot2)
pp <- ggplot(data=tea_vars_df, aes(x=Dim.1, y=Dim.2, label=Variable))+
geom_hline(yintercept = 0, colour = "gray70") +
geom_vline(xintercept = 0, colour = "gray70") +
geom_point()+
geom_text() +
ggtitle("MCA plot of variables ")+
theme_bw()
pp
})
### dendro
output$dendro <- renderPlot({
library(FactoMineR)
library(cluster)
tea.mca <- MCA(tea_selected(), ncp=9)
classif <- agnes(tea.mca$ind$coord,method="ward")
plot(classif,main="Dendrogram",ask=F,which.plots=2)
})
}
# Run the application
shinyApp(ui = ui, server = server)
答案 0 :(得分:0)
编辑:您可以看到明显的情节,但
<强> ORIGINAL 强>
我运行你的代码时,我无法在你闪亮的应用程序中看到情节。
经过一番挖掘后,我的猜测只是:
您使用FactoMineR
包附带的许多功能。例如,您在MCA
代码块中使用函数output$plot1
。在R命令行中键入MCA
,它应该打印该函数。你可以看到MCA
做了很多事情并最终调用了plot.MCA
。现在在R命令行中输入plot.MCA
。您可以看到plot.MCA
有很多plot
个命令,我很确定当您调用MCA
时,它会执行所有绘图。我认为您的问题是函数plot
中的plot.MCA
被发送到图形设备,并且这些图未保存,即它们不return()
到parent
环境。 这只是猜测。