reutils包中的esearch:如何指定数据集?

时间:2017-06-13 22:13:23

标签: r bioinformatics

我对reutils package有疑问。有一个名为esearch()的函数,它允许您搜索GEO数据库。所以,我输入了我在GEO中使用的相同查询:

UIDs <- esearch( term = "METHYLATION PROFILING BY ARRAY[DATASET TYPE]")

esearch()无法识别DATASET TYPE

如何将数据集类型指定为esearch()

1 个答案:

答案 0 :(得分:1)

我们需要指定数据库。对于GEO来说,这将是“gds”。 einfo()给出了数据库名称的向量。

UIDs <- esearch(term = "METHYLATION PROFILING BY ARRAY[DATASET TYPE]", db = "gds")