如果在双引号内有\ n(换行符),如何使用pgloader或PostgreSQL副本解析CSV?

时间:2017-06-07 17:20:08

标签: postgresql csv postgresql-copy pgloader

我有一个像这样的csv行:

"aaa"|"bbb"|"ccc"|"dddd
eeeee"

我想使用pgloader(http://pgloader.io/)或PostgreSQL COPY(https://www.postgresql.org/docs/9.6/static/sql-copy.html)导入此数据。我的问题在于,根据CSV标准,可以在引用的字段值中包含换行符(\ n)。但是pgloader以及COPY命令将它视为一个全新的数据行,而不是一个包含换行符的列。

COPY schema.table (
    col_aaa,
    col_bbb,
    col_ccc,
    col_ddd
) 
    FROM 'file.csv' WITH DELIMITER '|' ENCODING 'LATIN1' CSV;

我的COPY命令 我的pgloader命令

LOAD CSV
FROM 'file.csv' 
INTO postgresql://user:password@host:5432/database?schema.table (col_aaa, col_bbb, col_ccc, col_ddd)

WITH   
skip header = 0,
fields optionally enclosed by '"',
fields escaped by double-quote,
fields terminated by '|'  

SET client_encoding to 'latin1'
BEFORE LOAD DO
    $$ TRUNCATE anac.aerodromos_csv RESTART IDENTITY; $$;

我从PostgreSQL文档和谷歌搜索了很多。

我唯一发现的是:Parsing CSV file with \n in double quoted fields但是对于超过100万行的文件,awk太慢了。

有关如何操作的任何提示?

我的首选是pgloader,但我可以接受使用sed或perl作为regex代理来处理linux shell脚本中的文件。

有关如何操作的任何线索?

2 个答案:

答案 0 :(得分:0)

为了给你一个解决这个问题的想法,我正在写这个例子。

我刚认为该文件只包含4列,并且只包含1个换行符。如果不是这样,那么你需要改变它。

输入文件:

"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"dddd
eeeee"
"aaa"|"bbb"|"cc
c"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"b
bb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"a
aa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"dddd
eeeee"

<强> script.pl

#!/usr/bin/perl
use strict; use warnings; use Data::Dumper;

open ( my $RFH, '<', 'input.io' ) or die ($!);
open ( my $WFH, '>', 'output.o' ) or die ($!);

my $line_break = 0;
my $old_line = '';

while ( my $line = <$RFH> ) {
    chomp($line);
    if ( ! $line_break ){
        my @columns = split( /\|/, $line );
        if ( scalar( @columns ) == 4 && $columns[3] =~ m/"$/ ){
            print $WFH $line."\n";
        }
        else{
            $line_break = 1;
            $old_line = $line;
            next;
        }
    }
    else{
        $line = $old_line . $line;
        $old_line = '';
        $line_break = 0;
        print $WFH $line."\n";
    }
}

close($RFH);
close($WFH);

输出文件:

"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"
"aaa"|"bbb"|"ccc"|"ddddeeeee"

根据您的需要更改此示例。 希望这会有所帮助。

答案 1 :(得分:0)

问题是在行尾有一个\ r \ n。为了解决这个问题,我只从数据中的换行符中删除了\ r。

pgloader就是这样做的。

我通过使用一行perl来做到这一点。

perl -0777 -pi -e 's/(?<="[^"|])*(?<!["|])\r\n(?=[^"]*")/\n/smg' $csv_file_name # O -0777 is explained at em https://stackoverflow.com/questions/9670426/perl-command-line-multi-line-replace

Perl command line multi-line replace