我正试图通过MPI传达不同大小的std::vector<MyClass>
。 MyClass
包含的成员可能是未初始化或大小不同的向量。为此,我编写了一个serialize()
和deserialize()
函数,用于读取和写入std::vector<MyClass>
到std::string
,然后我通过MPI进行通信。
class MyClass {
...
int some_int_member;
std::vector<float> some_vector_member;
}
std::vector<MyClass> deserialize(const std::string &in) {
std::istringstream iss(in);
size_t total_size;
iss.read(reinterpret_cast<char *>(&total_size), sizeof(total_size));
std::vector<MyClass> out_vec;
out_vec.resize(total_size);
for(MyClass &d: out_vec) {
size_t v_size;
iss.read(reinterpret_cast<char *>(&d.some_int_member), sizeof(d.some_int_member));
iss.read(reinterpret_cast<char *>(&v_size), sizeof(v_size));
d.some_vector_member.resize(v_size);
iss.read(reinterpret_cast<char *>(&d.some_vector_member[0]), v_size * sizeof(float));
}
return out_vec;
}
std::string serialize(std::vector<MyClass> &data) {
std::ostringstream os;
size_t total_size = data.size();
os.write(reinterpret_cast<char *>(&total_size), sizeof(total_size));
for(MyClass &d: data) {
size_t v_size = d.some_vector_member.size();
os.write(reinterpret_cast<char *>(&some_int_member), sizeof(some_int_member));
os.write(reinterpret_cast<char *>(&v_size), sizeof(v_size));
os.write(reinterpret_cast<char *>(&d.some_vector_member[0]), v_size * sizeof(float));
}
return os.str();
}
我的实现原则上是有效的,但有时(并不总是!)MPI进程在我认为与序列化相关的位置崩溃。发送的有效负载可以与MB的数据库一样大。我怀疑使用std::string
作为容器不是一个好选择。使用std::string
作为char[]
的容器是否存在一些限制,我可能会遇到大量二进制数据?
(注意,我不想使用boost::mpi
及其序列化例程,我也不想将cereal
等大型库引入我的项目中
答案 0 :(得分:1)
通常情况下,使用std::string
表示二进制数据是可以的,尽管有些人可能更喜欢{+ 1}} - 或{CES 17中的std::vector<char>
see also,请注意C ++ 11字符串保证连续数据)。您的代码中存在两个显着的效率问题:
std::vector<std::byte>
和中间string
。[io]stringstream
中预分配(保留)数据,这可能会导致过度分配和频繁重新分配。因此,您浪费了大量内存,这可能会导致ostringstream
。也就是说,它可能非常好,你只是在某个地方有内存泄漏。在不知道bad_alloc
的原因和应用程序性能分析的情况下,无法判断这是否是一个实际问题。