矩阵乘法与块

时间:2017-06-05 18:10:00

标签: c matrix matrix-multiplication c99

这是我加速矩阵乘法的代码,但它比简单乘法快5%。 我能做些什么来尽可能地提升它?

*正在访问这些表格,例如: C [sub2ind(i,j,n)] ,用于 C [i,j] 位置。

void matrixMultFast(float * const C,            /* output matrix */
                float const * const A,      /* first matrix */
                float const * const B,      /* second matrix */
                int const n,                /* number of rows/cols */
                int const ib,               /* size of i block */
                int const jb,               /* size of j block */
                int const kb)               /* size of k block */
{

int i=0, j=0, jj=0, k=0, kk=0;
float sum;

for(i=0;i<n;i++)
    for(j=0;j<n;j++)
        C[sub2ind(i,j,n)]=0;

for(kk=0;kk<n;kk+=kb)
{
    for(jj=0;jj<n;jj+=jb)
    {
        for(i=0;i<n;i++)
        {
            for(j=jj;j<jj+jb;j++)
            {
                sum=C[sub2ind(i,j,n)];
                for(k=kk;k<kk+kb;k++)
                    sum += A[sub2ind(i,k,n)]*B[sub2ind(k,j,n)];
                C[sub2ind(i,j,n)]=sum;
            }
        }
    }
}
} // end function 'matrixMultFast4'

*用C语言编写,需要支持C99

1 个答案:

答案 0 :(得分:6)

你可以做很多很多事情来提高矩阵乘法的效率。

为了研究如何改进基本算法,让我们首先看看我们当前的选项。当然,天真的实现有3个循环,时间复杂度大约为O(n^3)。还有另一种称为Strassen方法的方法,它实现了明显的加速并且具有O(n^2.73)的顺序(但实际上没有用,因为它没有提供明显的优化方法)。

这是理论上的。现在考虑矩阵如何存储在内存中。行专业是标准,但你也找到专业。根据方案,转置矩阵可能会因缓存未命中次数减少而提高速度。理论上的矩阵乘法只是一堆矢量点积和加法。相同的向量将由多个向量操作,因此将该向量保持在高速缓存中以便更快地访问是有意义的。

现在,随着多核,并行和缓存概念的引入,游戏发生了变化。如果我们仔细观察一下,我们会看到一个点积只不过是一堆乘法,然后是求和。这些乘法可以并行完成。因此,我们现在可以查看数字的并行加载。

现在让我们让事情变得更复杂一些。在谈论矩阵乘法时,单个浮点和双浮点的大小有所不同。通常前者是32位,而后者是64位(当然,这取决于CPU)。每个CPU只有固定数量的寄存器,这意味着您的数字越大,您在CPU中的适应性就越小。故事的道德是,坚持单浮点,除非你真的需要加倍。

现在我们已经了解了如何调整矩阵乘法的基础知识,不用担心。您不需要对上面讨论的内容执行任何操作,因为已经有子程序可以执行此操作。正如评论中所提到的,有GotoBLAS,OpenBLAS,Intel的MKL和Apple的Accelerate框架。 MKL / Accelerate是专有的,但OpenBLAS是一种非常有竞争力的选择。

这是一个很好的小例子,在我的Macintosh上在几毫秒内将2 8k x 8k矩阵相乘:

#include <sys/time.h>
#include <stdio.h>
#include <stdlib.h>
#include <unistd.h>
#include <Accelerate/Accelerate.h>

int SIZE = 8192;

typedef float point_t;

point_t* transpose(point_t* A) {    
    point_t* At = (point_t*) calloc(SIZE * SIZE, sizeof(point_t));    
    vDSP_mtrans(A, 1, At, 1, SIZE, SIZE);

    return At;
}

point_t* dot(point_t* A, point_t* B) {
    point_t* C = (point_t*) calloc(SIZE * SIZE, sizeof(point_t));       
    int i;    
    int step = (SIZE * SIZE / 4);

    cblas_sgemm (CblasRowMajor, 
       CblasNoTrans, CblasNoTrans, SIZE/4, SIZE, SIZE,
       1.0, &A[0], SIZE, B, SIZE, 0.0, &C[0], SIZE);

    cblas_sgemm (CblasRowMajor, 
       CblasNoTrans, CblasNoTrans, SIZE/4, SIZE, SIZE,
       1.0, &A[step], SIZE, B, SIZE, 0.0, &C[step], SIZE);

    cblas_sgemm (CblasRowMajor, 
       CblasNoTrans, CblasNoTrans, SIZE/4, SIZE, SIZE,
       1.0, &A[step * 2], SIZE, B, SIZE, 0.0, &C[step * 2], SIZE);

    cblas_sgemm (CblasRowMajor, 
       CblasNoTrans, CblasNoTrans, SIZE/4, SIZE, SIZE,
       1.0, &A[step * 3], SIZE, B, SIZE, 0.0, &C[step * 3], SIZE);      

    return C;
}

void print(point_t* A) {
    int i, j;
    for(i = 0; i < SIZE; i++) {
        for(j = 0; j < SIZE; j++) {
            printf("%f  ", A[i * SIZE + j]);
        }
        printf("\n");
    }
}

int main() {
    for(; SIZE <= 8192; SIZE *= 2) {
        point_t* A = (point_t*) calloc(SIZE * SIZE, sizeof(point_t));
        point_t* B = (point_t*) calloc(SIZE * SIZE, sizeof(point_t));

        srand(getpid());

        int i, j;
        for(i = 0; i < SIZE * SIZE; i++) {
            A[i] = ((point_t)rand() / (double)RAND_MAX);
            B[i] = ((point_t)rand() / (double)RAND_MAX);
        }

        struct timeval t1, t2;
        double elapsed_time;

        gettimeofday(&t1, NULL);
        point_t* C = dot(A, B);
        gettimeofday(&t2, NULL);

        elapsed_time = (t2.tv_sec - t1.tv_sec) * 1000.0;      // sec to ms
        elapsed_time += (t2.tv_usec - t1.tv_usec) / 1000.0;   // us to ms

        printf("Time taken for %d size matrix multiplication: %lf\n", SIZE, elapsed_time/1000.0);

        free(A);
        free(B);
        free(C);

    }
    return 0;
}

此时我还应该提到SSE(流式SIMD扩展),这基本上是你不应该做的事情,除非你已经使用汇编。基本上,您可以矢量化您的C代码,使用向量而不是整数。这意味着您可以操作数据块而不是单个值。编译器放弃并只是按原样转换代码而不进行自己的优化。如果做得好,它可以像以前一样加速你的代码 - 你甚至可以触及O(n^2)的理论底线!但很容易滥用SSE,不幸的是大多数人都这样做了,最终结果比以前更糟糕。

我希望这能激励你深入挖掘。矩阵乘法的世界是一个庞大而迷人的世界。下面,我附上链接以供进一步阅读。

  1. OpenBLAS
  2. More about SSE
  3. Intel Intrinsics