Matlab分段违规和内存断言失败

Question

我在使用Matlab 2016b的Sun Grid Engine上并行运行多个Matlab作业。在我个人的Macbook上，我正在运行Matlab 2016a。该脚本正在进行一些MRI图像处理，其中每个作业使用一组不同的参数，以便我可以为我的图像处理程序进行参数优化。

然而，大约一半的工作都会因分段违规， malloc.c内存断言失败而崩溃（＆＃39;您可能修改过的内存不属于您。＆＃39;）或 HDF5-DIAG 中的错误，然后是分段违规。

一些观察

1. 错误并不总是发生在相同的作业或相同的作业中 功能，但崩溃发生在几组作业中，其中一个组内的作业在一分钟内崩溃。
2. 我不再使用动态数组，而是预先分配我的 阵列。如果阵列太小，我会延长它们 例如cat(array, zeros(1, 2000))。
3. 工作部分使用 相同的计算，以便他们可以共享数据。我先这样做 检查数据是否已由另一个作业生成。如果是这样 尝试使用具有最大尝试次数的while循环加载它 并暂停1秒（因为当另一份工作时，它可能会失败 仍然写入文件，如果它等待一点并重试它可能 成功）。如果在最大尝试次数后加载失败 或者如果数据尚不存在，则此作业执行 需要计算并尝试保存数据。如果数据是 在此期间由另一份工作保存，然后这份工作没有保存 数据了。
4. 我没有使用任何C / C ++或MEX文件。
5. 我用Matlab 2016a在自己的笔记本电脑上测试了一些作业的子集，在使用Matlab 2016b的Linux计算机上测试过，这些工作正常。但同样，问题只发生在几百次（总共500次迭代）之后，并且我没有在我自己的计算机上运行完整的模拟，但由于时间限制，只有大约20次迭代。