Python:pandas合并多个数据帧

时间:2017-06-02 11:38:06

标签: python pandas dataframe merge data-analysis

我有不同的数据框,需要根据日期列将它们合并在一起。如果我只有两个数据帧,我可以使用df1.merge(df2, on='date'),使用三个数据帧,我使用df1.merge(df2.merge(df3, on='date'), on='date'),但是使用多个数据帧变得非常复杂且难以理解。

所有数据框都有一个共同的列 - date,但它们没有相同数量的行或列,我只需要每个日期对每个数据帧都是通用的那些行。

所以,我正在尝试编写一个递归函数,它返回一个包含所有数据的数据帧,但它不起作用。那我该如何合并多个数据帧呢?

我尝试了不同的方法并遇到了out of rangekeyerror 0/1/2/3can not merge DataFrame with instance of type <class 'NoneType'>等错误。

这是我写的剧本:

dfs = [df1, df2, df3] # list of dataframes

def mergefiles(dfs, countfiles, i=0):
    if i == (countfiles - 2): # it gets to the second to last and merges it with the last
        return

    dfm = dfs[i].merge(mergefiles(dfs[i+1], countfiles, i=i+1), on='date')
    return dfm

print(mergefiles(dfs, len(dfs)))

一个例子: df_1:

May 19, 2017;1,200.00;0.1%
May 18, 2017;1,100.00;0.1%
May 17, 2017;1,000.00;0.1%
May 15, 2017;1,901.00;0.1%

df_2:

May 20, 2017;2,200.00;1000000;0.2%
May 18, 2017;2,100.00;1590000;0.2%
May 16, 2017;2,000.00;1230000;0.2%
May 15, 2017;2,902.00;1000000;0.2%

df_3:

May 21, 2017;3,200.00;2000000;0.3%
May 17, 2017;3,100.00;2590000;0.3%
May 16, 2017;3,000.00;2230000;0.3%
May 15, 2017;3,903.00;2000000;0.3%

预期的合并结果:

May 15, 2017;  1,901.00;0.1%;  2,902.00;1000000;0.2%;   3,903.00;2000000;0.3%   

11 个答案:

答案 0 :(得分:31)

如果不涉及复杂查询,下面是合并多个数据帧的最简洁,最易理解的方法。

只需简单地与 DATE 合并作为索引,然后使用 OUTER 方法进行合并(以获取所有数据)。

import pandas as pd
from functools import reduce

df1 = pd.read_table('file1.csv', sep=',')
df2 = pd.read_table('file2.csv', sep=',')
df3 = pd.read_table('file3.csv', sep=',')

因此,基本上将您拥有的所有文件作为数据框加载。然后使用mergereduce函数合并文件。

# compile the list of dataframes you want to merge
data_frames = [df1, df2, df3]

您可以在上面的代码中添加任意数量的数据框。这是此方法的好处。不涉及复杂的查询。

要保留属于同一日期的值,您需要将其合并到DATE

df_merged = reduce(lambda  left,right: pd.merge(left,right,on=['DATE'],
                                            how='outer'), data_frames)

# if you want to fill the values that don't exist in the lines of merged dataframe simply fill with required strings as

df_merged = reduce(lambda  left,right: pd.merge(left,right,on=['DATE'],
                                            how='outer'), data_frames).fillna('void')
  • 因此,同一天的值在同一行。
  • 您可以使用fillna()为不同的列填充不同帧的非现有数据。

然后根据需要将合并数据写入csv文件。

pd.DataFrame.to_csv(df_merged, 'merged.txt', sep=',', na_rep='.', index=False)

这应该给你

DATE VALUE1 VALUE2 VALUE3 ....

答案 1 :(得分:7)

看起来数据具有相同的列,因此您可以:

df1 = pd.DataFrame(data1)
df2 = pd.DataFrame(data2)

merged_df = pd.concat([df1, df2])

答案 2 :(得分:3)

有两个解决方案,但它分别返回所有列:

import functools

dfs = [df1, df2, df3]

df_final = functools.reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,on='date'), dfs)
print (df_final)
          date     a_x   b_x       a_y      b_y   c_x         a        b   c_y
0  May 15,2017  900.00  0.2%  1,900.00  1000000  0.2%  2,900.00  2000000  0.2%

k = np.arange(len(dfs)).astype(str)
df = pd.concat([x.set_index('date') for x in dfs], axis=1, join='inner', keys=k)
df.columns = df.columns.map('_'.join)
print (df)
                0_a   0_b       1_a      1_b   1_c       2_a      2_b   2_c
date                                                                       
May 15,2017  900.00  0.2%  1,900.00  1000000  0.2%  2,900.00  2000000  0.2%

答案 3 :(得分:2)

@ dannyeuu的回答是正确的。如果将axis选项设置为1,pd.concat自然会在索引列上进行连接。默认为外连接,但您也可以指定内连接。这是一个例子:

x = pd.DataFrame({'a': [2,4,3,4,5,2,3,4,2,5], 'b':[2,3,4,1,6,6,5,2,4,2], 'val': [1,4,4,3,6,4,3,6,5,7], 'val2': [2,4,1,6,4,2,8,6,3,9]})
x.set_index(['a','b'], inplace=True)
x.sort_index(inplace=True)

y = x.__deepcopy__()
y.loc[(14,14),:] = [3,1]
y['other']=range(0,11)

y.sort_values('val', inplace=True)

z = x.__deepcopy__()
z.loc[(15,15),:] = [3,4]
z['another']=range(0,22,2)
z.sort_values('val2',inplace=True)


pd.concat([x,y,z],axis=1)

答案 4 :(得分:2)

functools.reduce pd.concat 是很好的解决方案,但是就执行时间而言pd.concat是最好的。

from functools import reduce
import pandas as pd

dfs = [df1, df2, df3, ...]
nan_value = 0

# solution 1 (fast)
result_1 = pd.concat(dfs, join='outer', axis=1).fillna(nan_value)

# solution 2
result_2 = reduce(lambda left,right: pd.merge(df_left, df_right, 
                                              left_index=True, right_index=True, 
                                              how='outer'), 
                  dfs).fillna(nan_value)

答案 5 :(得分:2)

另一种组合方式:functools.reduce

来自文档:

<块引用>

例如,reduce(lambda x, y: x+y, [1, 2, 3, 4, 5]) 计算 ((((1+2)+3)+4)+5)。左边的参数 x 是累加值,右边的参数 y 是可迭代对象的更新值。

所以:

from functools import reduce
dfs = [df1, df2, df3, df4, df5, df6]
df_final = reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,on='some_common_column_name'), dfs)

答案 6 :(得分:1)

如果您按普通日期过滤,则会将其返回:

dfs = [df1, df2, df3]
checker = dfs[-1]
check = set(checker.loc[:, 0])

for df in dfs[:-1]:
    check = check.intersection(set(df.loc[:, 0]))

print(checker[checker.loc[:, 0].isin(check)])

答案 7 :(得分:1)

看看这个pandas three-way joining multiple dataframes on columns

filenames = ['fn1', 'fn2', 'fn3', 'fn4',....]
dfs = [pd.read_csv(filename, index_col=index_col) for filename in filenames)]
dfs[0].join(dfs[1:])

答案 8 :(得分:1)

@everestial007 的解决方案对我有用。这就是我为我的用例改进它的方法,即让每个不同 df 的列具有不同的后缀,以便我可以更轻松地区分最终合并数据帧中的 dfs。

from functools import reduce
import pandas as pd
dfs = [df1, df2, df3, df4]
suffixes = [f"_{i}" for i in range(len(dfs))]
# add suffixes to each df
dfs = [dfs[i].add_suffix(suffixes[i]) for i in range(len(dfs))]
# remove suffix from the merging column
dfs = [dfs[i].rename(columns={f"date{suffixes[i]}":"date"}) for i in range(len(dfs))]
# merge
dfs = reduce(lambda left,right: pd.merge(left,right,how='outer', on='date'), dfs)

答案 9 :(得分:0)

感谢您的帮助 @jezrael @zipa @ everestial007 ,这两个答案都是我需要的。如果我想做一个递归,这也可以按预期工作:

def mergefiles(dfs=[], on=''):
    """Merge a list of files based on one column"""
    if len(dfs) == 1:
         return "List only have one element."

    elif len(dfs) == 2:
        df1 = dfs[0]
        df2 = dfs[1]
        df = df1.merge(df2, on=on)
        return df

    # Merge the first and second datafranes into new dataframe
    df1 = dfs[0]
    df2 = dfs[1]
    df = dfs[0].merge(dfs[1], on=on)

    # Create new list with merged dataframe
    dfl = []
    dfl.append(df)

    # Join lists
    dfl = dfl + dfs[2:] 
    dfm = mergefiles(dfl, on)
    return dfm

答案 10 :(得分:0)

对我来说,索引在没有明确说明的情况下被忽略。示例:

    > x = pandas.DataFrame({'a': [1,2,2], 'b':[4,5,5]})
    > x
        a   b
    0   1   4
    1   2   5
    2   2   5

    > x.drop_duplicates()
        a   b
    0   1   4
    1   2   5

(尽管索引不同,但删除了重复的行)