如何在巨大数据帧的每一行中查找top-n值的列索引

时间:2017-06-01 12:56:05

标签: python pandas sorting rank top-n

我有一个格式的数据框:(示例数据)

      Metric1  Metric2  Metric3  Metric4  Metric5
ID    
1     0.5      0.3      0.2      0.8      0.7    
2     0.1      0.8      0.5      0.2      0.4    
3     0.3      0.1      0.7      0.4      0.2    
4     0.9      0.4      0.8      0.5      0.2    

其中得分范围在[0,1]和我希望生成一个函数,对于每个id(行),计算前n个度量,其中n是函数的输入以及原始数据帧。

我的理想输出是:(例如,n = 3)

      Top_1     Top_2     Top_3
ID    
1     Metric4   Metric5   Metric1    
2     Metric2   Metric3   Metric5    
3     Metric3   Metric4   Metric1    
4     Metric1   Metric3   Metric4  

现在我编写了一个可行的功能:

def top_n_partners(scores,top_n=3):
metrics = np.array(scores.columns)
records=[]
for rec in scores.to_records():
    rec = list(rec)
    ID = rec[0]
    score_vals = rec[1:]
    inds = np.argsort(score_vals)
    top_metrics = metrics[inds][::-1]
    dic = {
        'top_score_%s' % (i+1):top_metrics[i]
        for i in range(top_n)
    }
    dic['ID'] = ID
    records.append(dic)
top_n_df = pd.DataFrame(records)
top_n_df.set_index('ID',inplace=True)
return top_n_df

然而,它似乎相当低效/缓慢,特别是对于我正在运行的数据量(具有数百万行的数据帧)而且我想知道是否有更聪明的方法可以解决这个问题?

2 个答案:

答案 0 :(得分:7)

您可以使用numpy.argsort

print (np.argsort(-df.values, axis=1)[:,:3])
[[3 4 0]
 [1 2 4]
 [2 3 0]
 [0 2 3]]

print (df.columns[np.argsort(-df.values, axis=1)[:,:3]])

Index([['Metric4', 'Metric5', 'Metric1'], ['Metric2', 'Metric3', 'Metric5'],
       ['Metric3', 'Metric4', 'Metric1'], ['Metric1', 'Metric3', 'Metric4']],
      dtype='object')

df = pd.DataFrame(df.columns[np.argsort(-df.values, axis=1)[:,:3]], 
                               index=df.index)
df = df.rename(columns = lambda x: 'Top_{}'.format(x + 1))
print (df)
      Top_1    Top_2    Top_3
ID                           
1   Metric4  Metric5  Metric1
2   Metric2  Metric3  Metric5
3   Metric3  Metric4  Metric1
4   Metric1  Metric3  Metric4 

感谢Divakar改进:

n = 3
df = pd.DataFrame(df.columns[df.values.argsort(1)[:,-n+2:1:-1]], 
                               index=df.index)

df = df.rename(columns = lambda x: 'Top_{}'.format(x + 1))
print (df)
      Top_1    Top_2    Top_3
ID                           
1   Metric4  Metric5  Metric1
2   Metric2  Metric3  Metric5
3   Metric3  Metric4  Metric1
4   Metric1  Metric3  Metric4                

答案 1 :(得分:3)

使用Pandas重塑的另一种方式:

df.set_index('ID', inplace=True)
df_out = df.rank(axis=1, ascending=False).astype(int).reset_index().melt(id_vars='ID').query('value <= 3').pivot(index='ID',columns='value')
df_out.columns = df_out.columns.droplevel().astype(str)
df_out = df_out.add_prefix('Top_')
print(df_out)

输出:

value    Top_1    Top_2    Top_3
ID                              
1      Metric4  Metric5  Metric1
2      Metric2  Metric3  Metric5
3      Metric3  Metric4  Metric1
4      Metric1  Metric3  Metric4