如何从图像中删除一些注释？

时间：2017-06-01 05:14:51

标签： annotations dm-script

我有一个周期性排列的原子图像，每个原子都标有椭圆形注释。我想知道如何从图像中删除一些注释。请有人帮帮我吗？

第一次回答后编辑

image img := GetFrontImage()
component imgdisp = ImageGetImageDisplay( img, 0 )
number count_oval = imgdisp.ComponentCountChildrenOfType(6)
okdialog("There are "+count_oval+" oval annotations")
number i

    for( i=1; i<=count_oval; i++)
    {   while(3<=i<=5)
         { component annot=imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(6,0)
           annot.ComponentRemoveFromParent()
         }
    }

你能帮我解决一下我的代码中哪一部分是错误的，因为我无法删除位于中间中的一些注释吗？

2 个答案:

答案 0 :(得分：1)

要使用注释执行操作，您可以使用一些简化编码界面，如参考部分所述：

enter image description here

或者您可以使用＆＃34;完成＆＃34;界面，我将在下面给你看。 注释是DigitalMicrograph中的一种Component。 （其他人是ROI，ImageDisplay和ImageDocument的 root 。您可以在此处找到所有需要的命令（F1帮助）：

enter image description here 

// Get the imageDisplay from the image
// (It is the "parent" component of all things displayed on the image.)
image img := GetFrontImage()
imageDisplay disp = img.ImageGetImageDisplay(0)

// If you want to remove components of a specific type
number annoType = 5 // Box
number nBoxAnno = disp.ComponentCountChildrenOfType( annoType )
OKDialog( "There are " + nBoxAnno + " annotations of type " + annoType + ".\nRemove them now." )
for( number i = 0; i<nBoxAnno; i++ )
{
    // Get first existing component of a specific type
    component boxComp = disp.ComponentGetNthChildOfType( annoType, 0 )  
    // Remove it from its parent component (the imageDisplay)
    boxComp.ComponentRemoveFromParent()
}

// If you want to remove all components of a specific type
number nAllAnno = disp.ComponentCountChildren()
OKDialog( "There are " + nAllAnno + " child components.\nRemove them now." )
for( number i = 0; i<nAllAnno; i++ )
{
    // Get first existing component 
    component anyComp = disp.ComponentGetChild( 0 ) 
    // Remove it from its parent component (the imageDisplay)
    anyComp.ComponentRemoveFromParent()
}
  

在示例中，我删除了一种类型的所有注释。如果要删除的一些，则需要修改for循环。您可以对组件执行不同的检查，以查看是否要将其删除。

更好理解的一些更广泛的解释：

您需要知道每个Image是内存中的数据（加上校准和标签）。每个Image可以有一个或多个ImageDisplays，它们是负责在屏幕上显示数据的对象。 （如Raster，LinePlot，Spreadsheet ......）。写入硬盘的整体对象是ImageDocument。

每个ImageDisplay只与一个Image（数据）相关联，但每个Image可能有多个独立ImageDisplay。 Image可以在没有ImageDisplay的情况下存在（它在内存中只是不可见，并且在脚本结束时将从内存中删除。）ImageDisplay在没有{{1}的情况下不能存在}。

每个Image包含多个ImageDocument（以及相关的ImageDisplays）。 Images也可以不包含“ImageDisplay”。 - 那时它是一个空页。

在＆＃39; normal＆＃39;简单的情况是，当您在脚本中创建ImageDocument时，它首先是不可见的，没有image且没有ImageDisplay，但是当您第一次显示它时，{{1}并自动创建ImageDocument：

ImageDisplay

现在，正如所说的那样，注释只是ImageDocument中的一种 - 就像image img := RealImage( "Test", 4, 100, 100 ) // imageDisplay disp1 = img.ImageGetImageDisplay(0) // Does not work yet! img.ShowImage() imageDisplay disp = img.ImageGetImageDisplay(0) imageDocument doc = img.ImageGetOrCreateImageDocument() // Always works 本身一样 - 因此可以使用component的所有命令。任何＆＃39;组件＆＃39;可以有子组件（构建一棵树）。因此，您首先需要找到父，然后您可以计算子项的数量 - 全部或特定类型的子项 - 并迭代以获取它们。然后，您可以修改它们（颜色等）或从父项中删除，如上所示。

  

为什么这么复杂？
因为它是一个非常通用和灵活的概念！

示例1 ：您可以将一个图像（显示）作为子图像显示另一个图像（显示）。当你将一个图像复制到另一个图像时，你会得到这样的东西：

enter image description here

示例2 ：您可以拥有一个imageDisplay（数据），其中包含两个不同和独立components - 因此您可以显示相同的内容数据同时作为电子表格和光栅图像。

示例3 ：您可以同时使用一个image（也是imageDisplays）同时坐在两个不同的ROI上。如果你移动一个＆＃39;，其他＆＃39;也动了：

component

我鼓励你去玩＆＃39;使用imageDisplays，image img1 := RealImage( "img1", 4, 100, 100 ) image img2 := RealImage( "img2", 4, 100, 100 ) ROI theROI = NewROI() theROI.ROISetVolatile(0) theROI.ROISetRectangle( 10, 10, 30, 30 ) img1.ShowImage() img2.ShowImage() img1.ImageGetImageDisplay(0).ImageDisplayAddROI( theROI ) img2.ImageGetImageDisplay(0).ImageDisplayAddROI( theROI ) ，image，imageDocument和imageDisplay的概念来更好地理解内部运作。对于简单的脚本，您不需要它，但是当您想要创建更复杂的东西时，它是非常宝贵的知识。

答案 1 :(得分：1)

这个答案是指破碎的示例脚本

  

你不能像你那样做一个循环。

while( 2 <= i <= 5 )不是有效条件。如果你需要做这样的循环，它必须是while( (2 <= i) && ( i <= 5) )，你需要确保i实际上改变了循环中的值，或者它是一个无限循环！ 你基本上继续“去除椭圆形注释的第一次出现”，直到不再存在。然后下一个调用再也找不到了，脚本崩溃了。

  

您的脚本实际仅结束，因为发生了错误。

如果您只是删除错误的while循环，那么您的脚本完全没问题！

image img := GetFrontImage()
component imgdisp = ImageGetImageDisplay( img, 0 )
number count_oval = imgdisp.ComponentCountChildrenOfType(6)
okdialog("There are "+count_oval+" oval annotations")
number i

for( i=1; i<=count_oval; i++)
{   
    //while(3<=i<=5)  // Don't do this!
     { 
       component annot=imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(6,0)
       annot.ComponentRemoveFromParent()
     }
}

就个人而言，我会稍微改写代码，但这只是风格不起作用的问题：

for( number i = 0; i<count_oval; i++)
{   
    component annot=imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(6,0)
    annot.ComponentRemoveFromParent()
}

如果你想摆脱一个类型的所有注释，你也可以不计算它们，只是继续寻找它们，直到所有注释被删除：

number type = 6
image img := GetFrontImage()
component imgdisp = ImageGetImageDisplay( img, 0 )

while( 0 != imgdisp.ComponentCountChildrenOfType(type) )
    imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(type,0).ComponentRemoveFromParent()

现在，如果要删除组中“中间”的子集，则必须注意当删除项目时，会将其余项目的位置向下移动到列表中。只需考虑要删除中间两个的4个注释的示例。你不想要在第1和第2位连续删除，因为：

  • 在1位置删除 [anno0]， [anno1] ，[anno2]，[anno3]

  • 在2位置删除 [anno0]，[anno2]， [anno3]

  • [anno0]，[anno2]

    的 Oups！不是我们想要的......

所以要解决这个问题，你需要调整你的for循环。如果它是一个连续段，您只需将“get at”索引调整到该范围的第一个位置：

number type = 6
image img := GetFrontImage()
component imgdisp = ImageGetImageDisplay( img, 0 )
number nTotal = imgdisp.ComponentCountChildrenOfType(type)
number start = 2    // start index, so we are starting with the 3rd annotation
number nRange = 2   // We want to delete 3 annotations ( 3rd, 4th and 5th )

for( number i = 0; i < nRange; i++ )
    imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(type,start).ComponentRemoveFromParent()
  

注意：程序员的惯例是以0作为第一个位置开始索引。如果你从一开始就在自己的代码中开始遵循这个约定，那么你可以节省很多错误。 （对于索引像素，这也是如此。图像中的第一个像素是(0,0)而不是(1,1)！）

最后，有时你需要处理特定的组件和组件数量的变化 - f.e.因为用户交互 - 所以你不能依赖索引。您可以通过ID号识别组件来解决此问题。这个数字在DigitalMicrograph会议期间是独一无二的。 在识别组件时，您需要“存储”该号码。然后你可以稍后找到该组件。 （但如果找到了，你需要检查。） 这是一个例子：

number type = 6
image img := GetFrontImage()
component imgdisp = ImageGetImageDisplay( img, 0 )
number nTotal = imgdisp.ComponentCountChildrenOfType(type)

// Find the IDs of all annotations of this type 
// and store them in a tagGroup
ClearResults()
TagGroup compIDgroup = NewTagList()
for( number i = 0; i < nTotal; i++ )
{
    number cID =imgdisp.ComponentGetNthChildOfType(type,i).ComponentGetID()
    Result( "Annotation at index " + i + " has ID:" + cID + "\n" )
    compIDgroup.TagGroupInsertTagAsLong(  infinity(), cID ) // add to end of list
}

If ( TwoButtonDialog( "Show tags?", "Yes", "No" ))
    compIDgroup.TagGroupOpenBrowserWindow( "cIds", 0 )

// ... do whatever which adds or removes other components

// Process "your" annotations by the ID
number nIDs = compIDgroup.TagGroupCountTags()
for ( number i = 0 ; i < nIDs; i++ )
{
    number cID
    compIDGroup.TagGroupGetIndexedTagAsLong( i, cID )
    Result( "Processing tag of ID " + cID + "\n" )
    component comp = imgDisp.ComponentGetChildByID( cID )
    if ( !comp.ComponentIsValid() )
    {
        Result( "  NOT FOUND. Skip.\n" )
        continue        // jump to next step of for-loop 
    }
    comp.ComponentRemoveFromParent()
}
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