Question

我是netCDF库的新用户，所以我为这个基本问题道歉。我试图将具有4列（lon，lat，depth，velocity）的ascii文件转换为netCDF。我收到以下错误：

Vp [：] = file [：，：，：，] IndexError：数组

的索引太多

你能帮我找一下错误的原因吗？我已将变量的尺寸设置为行数。是吗？

提前致谢。

文件很大，您可以在此处找到示例：https://www.dropbox.com/s/qq9529vcvq8t1av/test.txt?dl=0

# -*- coding: utf-8 -*-
from netCDF4 import Dataset
import numpy as np
import sys


file = np.loadtxt('test.txt', delimiter=' ')
# NC file setup
mydata = Dataset('Vp.nc', 'w', format='NETCDF4')
mydata.description = '3D VP velocity model'

# dimensions
mydata.createDimension('latitude', 1000)
mydata.createDimension('longitude', 1000)
mydata.createDimension('depth', 1000)

Vp = mydata.createVariable('Vp', 'f4', ('latitude', 'longitude', 'depth'), fill_value=0)

Vp[:] = file[:,:,:]
Vp.units = 'km/s'

Answer 1

以下是几个问题

不要使用内置函数名作为变量名，例如file
不要将坐标数据放入变量，而应放入单独的变量
如果向NetCDF变量添加数据，则切片大小必须相等
您当前的错误只是从numpy数组中查询错误的维度，在您的示例文件中为1000,4

这是一个有效的例子，但我没有提取正确的变量数据，因为我不知道实际的结构，也要小心重塑。

from netCDF4 import Dataset
import numpy as np
import sys


input_file = np.loadtxt('test.txt', delimiter=' ')
# NC file setup
mydata = Dataset('Vp.nc', 'w', format='NETCDF4')
mydata.description = '3D VP velocity model'

# dimensions
mydata.createDimension('longitude', 128)
mydata.createDimension('latitude', 4)
lat = mydata.createVariable('latitude', 'f4','longitude')
lat.long_name = "latitude"
lat.units = "degrees_north"
lat.standard_name = "latitude"
lon = mydata.createVariable('longitude', 'f4','latitude')
lon.long_name = "longitude"
lon.units = "degrees_east"
lon.standard_name = "longitude"

## mydata.createVariable('depth', 1)

Vp = mydata.createVariable('Vp', 'f4', ('longitude','latitude'), fill_value=0)

Vp[:128,:4] = input_file[:512,3].reshape(128,4)
## lon[:] = ???
## lat[:] = ???
Vp.units = 'km/s'

Ascii到NetCDF的转换

1 个答案: