Question

我在macOS sierra（10.12.5）上运行R（版本3.4.0），我正在尝试使用需要使用rJava库的xlsx库。

当我尝试在R控制台中使用library(rJava)加载rJava时（如果在RStudio或终端中没有区别），我收到以下错误消息，我无法理解：

Fehler: package or namespace load failed for ‘rJava’:
 .onLoad in loadNamespace() für 'rJava' fehlgeschlagen, Details:
  Aufruf: dyn.load(file, DLLpath = DLLpath, ...)
  Fehler: kann shared object '/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so' nicht laden:
  dlopen(/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so, 6): Library not loaded: @rpath/libjvm.dylib
  Referenced from: /Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/rJava/libs/rJava.so
  Reason: image not found

谷歌搜索问题我发现一些帖子有些相似（但每次略有不同的问题），this SO question是其中最有希望的。

由于提议的步骤需要适应我的情况，而且我是一个新手，我无法实现它们。我该怎么办？

其他信息：

shell命令java -version返回：

java version "1.8.0_131"
Java(TM) SE Runtime Environment (build 1.8.0_131-b11)
Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM (build 25.131-b11, mixed mode)

shell命令R CMD javareconf返回：

Java interpreter : /usr/bin/java
Java version     : 1.8.0_131
Java home path   : /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java compiler    : /usr/bin/javac
Java headers gen.: /usr/bin/javah
Java archive tool: /usr/bin/jar
Non-system Java on macOS

trying to compile and link a JNI program 
detected JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
detected JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include -I/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/../include/darwin  -I/usr/local/include   -fPIC  -Wall -g -O2  -c conftest.c -o conftest.o
clang -dynamiclib -Wl,-headerpad_max_install_names -undefined dynamic_lookup -single_module -multiply_defined suppress -    L/Library/Frameworks/R.framework/Resources/lib -L/usr/local/lib -o conftest.so conftest.o -L/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre/lib/server -ljvm -F/Library/Frameworks/R.framework/.. -framework R -Wl,-framework -Wl,CoreFoundation


JAVA_HOME      /Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk1.8.0_131.jdk/Contents/Home/jre
Java library path: $(JAVA_HOME)/lib/server
JNI cpp flags    : -I$(JAVA_HOME)/../include -I$(JAVA_HOME)/../include/darwin
JNI linker flags : -L$(JAVA_HOME)/lib/server -ljvm
Updating Java configuration in /Library/Frameworks/R.framework/Resources
Done.

任何帮助将不胜感激！

Answer 1

有效！

在安装并重新安装不同的java版本并使用R命令install.packages("rJava")重新安装rJava之后，我已经到了在R控制台（shell窗口）中加载库的位置，不再抛出错误消息。

之后，我可以使用this post中的答案通过运行此shell命令使其在RStudio中工作：

sudo ln -f -s $(/usr/libexec/java_home)/jre/lib/server/libjvm.dylib /usr/local/lib

毕竟不是太复杂！谢谢大家耐心等待。

Answer 2

不同版本的MAC OS的JAVA_HOME路径不同。在某些情况下，有/jre个文件夹，在某些情况下，/Home导演不会在终端后使用CD命令手动转到/server文件夹并使用pwd复制整个路径使用它来设置java.home然后你可以轻松加载rJava库。这就是我能够解决问题的方法

options("java.home"="/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.0.1.jdk/Contents/Home/lib")

Sys.setenv(LD_LIBRARY_PATH='$JAVA_HOME/server')

dyn.load('/Library/Java/JavaVirtualMachines/jdk-9.0.1.jdk/Contents/Home/lib/server/libjvm.dylib')

library(rJava)

R，加载rJava错误

2 个答案: