Rcpp :: compileAttributes()错误

时间:2017-05-24 00:27:39

标签: rcpp

我正在尝试编制一个我已经制作的小包装。该软件包使用Rcpp和RcppArmadillo。一切都运行良好,直到我更新我的mac到Sierra(版本10.12.5)。从Rstudio(版本1.0.143)构建包时,我现在有以下错误消息:

Error in Rcpp::compileAttributes() : 
Evaluation error: no native symbols were extracted.
Calls: source ... withVisible -> eval -> eval -> <Anonymous> -> .Call
Execution halted

知道这是什么以及如何修复它?

非常感谢!

6 个答案:

答案 0 :(得分:6)

重命名包后出现同样的错误。

删除src/下的编译对象文件,例如xxx.oxxx.so后,再次有效。

答案 1 :(得分:4)

尝试

tools::package_native_routine_registration_skeleton(".", character_only = FALSE)

如果你没有第一次打电话,那么非直观的character_only = FALSE是必要的。

我在https://github.com/kbenoit/quanteda/issues/846从kbenoit复制了这个答案。当我遇到类似问题时,这对我有用。

答案 2 :(得分:3)

在我的情况下,当NAMESPACE文件出现问题或缺少NAMESPACE时会发生这种情况。有一个捕获22。 Roxygen2不会覆盖您的NAMESPACE文件,但是如果您删除它并运行roxygen来生成NAMESPACE文件,则会调用compileAttributes,但会挂起,因为缺少NAMESPACE文件。

答案 3 :(得分:1)

尝试删除RcppExports.cpp和RcppExports.o然后在构建选项中转到&#34;更多&#34; - &GT; &#34;清洁和重建&#34; 当我遇到类似的问题时,这通常可以解决问题

答案 4 :(得分:1)

我通过从GitHub在一个新目录中重新创建RStudio中的项目来修复我的问题。

我有同样的问题;发生在我正在处理与包无关的markdown文件时,但是所有突然的包都不会以相同的错误构建:

    > devtools::session_info()
Session info ----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 setting  value                       
 version  R version 3.5.0 (2018-04-23)
 system   x86_64, mingw32             
 ui       RStudio (1.1.453)           
 language (EN)                        
 collate  English_United States.1252  
 tz       America/Los_Angeles         
 date     2018-06-05                  

Packages --------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------
 package    * version    date       source                            
 assertthat   0.2.0      2017-04-11 CRAN (R 3.5.0)                    
 base       * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 bindr        0.1.1      2018-03-13 CRAN (R 3.5.0)                    
 bindrcpp     0.2.2      2018-03-29 CRAN (R 3.5.0)                    
 colorspace   1.3-2      2016-12-14 CRAN (R 3.5.0)                    
 compiler     3.5.0      2018-04-23 local                             
 datasets   * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 devtools     1.13.5     2018-02-18 CRAN (R 3.5.0)                    
 digest       0.6.15     2018-01-28 CRAN (R 3.5.0)                    
 dplyr        0.7.5      2018-05-19 CRAN (R 3.5.0)                    
 epicR      * 0.16.0     2018-06-06 local                             
 ggplot2      2.2.1.9000 2018-05-28 Github (tidyverse/ggplot2@4299917)
 ggthemes     3.5.0      2018-05-07 CRAN (R 3.5.0)                    
 glue         1.2.0      2017-10-29 CRAN (R 3.5.0)                    
 graphics   * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 grDevices  * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 grid         3.5.0      2018-04-23 local                             
 gtable       0.2.0      2016-02-26 CRAN (R 3.5.0)                    
 lazyeval     0.2.1      2017-10-29 CRAN (R 3.5.0)                    
 magrittr     1.5        2014-11-22 CRAN (R 3.5.0)                    
 memoise      1.1.0      2017-04-21 CRAN (R 3.5.0)                    
 methods    * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 munsell      0.4.3      2016-02-13 CRAN (R 3.5.0)                    
 pillar       1.2.3      2018-05-25 CRAN (R 3.5.0)                    
 pkgconfig    2.0.1      2017-03-21 CRAN (R 3.5.0)                    
 plyr         1.8.4      2016-06-08 CRAN (R 3.5.0)                    
 purrr        0.2.5      2018-05-29 CRAN (R 3.5.0)                    
 R6           2.2.2      2017-06-17 CRAN (R 3.5.0)                    
 Rcpp         0.12.17    2018-05-18 CRAN (R 3.5.0)                    
 rlang        0.2.1      2018-05-30 CRAN (R 3.5.0)                    
 scales       0.5.0      2017-08-24 CRAN (R 3.5.0)                    
 stats      * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 tibble       1.4.2      2018-01-22 CRAN (R 3.5.0)                    
 tidyselect   0.2.4      2018-02-26 CRAN (R 3.5.0)                    
 tools        3.5.0      2018-04-23 local                             
 utils      * 3.5.0      2018-04-23 local                             
 withr        2.1.2      2018-03-15 CRAN (R 3.5.0)                    
 yaml         2.1.19     2018-05-01 CRAN (R 3.5.0) 

答案 5 :(得分:0)

我不知道这是否可以解决问题,但是我遇到了类似的问题,因为我将该软件包命名为“ xxx_package”。我不记得到底发生了什么,我想我发现了,因为当我尝试在Rstudio中创建一个具有类似名称的新程序包时,该名称出现错误,只允许使用字母和数字。 Rcpp::compileAttributes甚至Rcpp::Rcpp.package.skeleton都没有抱怨过这个名字。我尝试使用tools::package_native_routine_registration_skeleton(".", character_only = FALSE)无济于事。

无论如何,在创建一个名为“ xxxPackage”的新程序包后,所有问题均已解决。