HTCondor与OpenFOAM

Question

我正在尝试从HTCondor在OpenFOAM中启动一些计算。 到目前为止，我们只准备了一个多核服务器OpenFOAM。 OpenFOAM按照以下内容中的说明从源（不使用docker）安装：https://openfoam.org/download/4-1-source/

问题：当我在HTCondor中提交作业时，它正确启动（我看到生成了结果文件）但是输出文件没有被复制回提交的机器（在Windows上）。

这是我的工作档案：

Universe = vanilla
Executable = openfoamtest.sh

process_name = openfoamtest
input = /dev/null
requirements = ( (OpSys == "LINUX") && (Machine == "master") )

output = $(process_name).job.$(Process).out 
error = $(process_name).job.$(Process).err 
log = $(process_name).job.log

should_transfer_files = YES
when_to_transfer_output = ON_EXIT_OR_EVICT
transfer_executable = true

Queue 1

openfoamtest.sh：

#!/bin/bash
# Import the OpenFOAM environment
source /etc/bashrc
export PATH=$PATH:/usr/lib64/openmpi/bin/
source /opt/OpenFOAM/OpenFOAM-4.1/etc/bashrc

cd /tmp/openfoam/pitzDaily
blockMesh
simpleFoam
zip pitzDaily.zip *

请注意，我使用 condorworker 用户启动流程而不是用户 nobody 。提交是从Windows计算机。 谢谢。

Answer 1

解决。问题是我的脚本中的“cd”。这将当前工作目录移动到另一个文件夹，HTCondor不知道。解决方案是添加， 在开始时：

# This is the folder where Condor starts
CURRENT_FOLDER=$PWD

最后：

# Copy back the generated file to Condor's execute folder.
cp pitzDaily.zip $CURRENT_FOLDER