必须安装jupyter-client，但是“jupyter kernelspec --version”退出代码为127

Question

我已经在我的ubuntu 16.04机器上安装了Jupyter笔记本。在jupyter笔记本中默认安装了python。现在我想从jupyter笔记本中使用R.

为此，我按照IRkernel installation link运行以下命令：

install.packages('devtools')

devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')

但是当我跑步的时候 IRkernel::installspec()命令显示如下错误：

  

必须安装jupyter-client但是“jupyter kernelspec --version”退出代码127

我现在很困惑为什么会出现这种错误。

Answer 1

从RStudio运行此命令将显示此错误。当您从命令行/终端运行此命令时，一切都会正常。

只需从命令行输入R即可。

然后运行以下命令：

install.packages('devtools')

devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')

IRkernel::installspec()

Answer 2

在某些Windows系统上，即使从cmd / powershell运行R，也可能无法成功。在我的机器上就是这种情况。我的解决方法是从Anaconda Prompt运行R（如果您通过Anaconda安装了Jupyter）。如果您的PATH上没有R，则可能需要指定完整路径。

我认为这是与PATH相关的问题，但我没有把Anaconda\Lib\site-packages\jupyter_client添加到我的系统PATH中。

Answer 3

我已经解决了这个问题：

sudo ln -s / home /'我的用户名'/ anaconda3 / bin / jupyter / usr / bin / jupyter

Answer 4

1. 如果已安装Anaconda并附带了Jupyter-Notebook（应为标准安装），请打开Anaconda提示符，而不是Windows命令提示符或Anaconda Navigator
2. 查找R的可执行文件（不是Rgui或Rstudio），它应位于C：\ Program Files \ R \ R-3.5.1 \ bin之类，并记住路径键入 cd C:\Program Files\R\R-3.5.1\bin，然后输入R
来开始R
3. 键入IRkernel::installspec()
4. 现在您可以在Jupyter-Notebook中启动R内核

Answer 5

我遇到了同样的错误，但解决方法有所不同：

确保您的系统上还安装了anaconda！ （或者至少是jupyter） https://conda.io/docs/user-guide/install/index.html

Answer 6

添加此功能的任何人，谷歌搜索和卡在这个问题可能会从这个简单的学习中受益。我得到了同样的错误，如上所述，按照上面的说明（在终端中启动R）：

IRkernel::installspec() 
Error in IRkernel::installspec() : 
    jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 127.

在Bash中我跑了：

Mac-Pro:~ $ jupyter kernelspec --version
-bash: jupyter: command not found

Duh ，我没有安装Jupyter。使用：brew install jupyter安装Jupyter（在mac上，使用brew）。可以找到其他操作系统的安装说明here。

一切正常。

Answer 7

我在 linux 中为 R 安装 jupyter notebook，当我为 jupyter 添加 IRkernel 时，我遇到了同样的错误。然后我使用 Linux 终端安装 jupyter-client sudo apt-get install jupyter-client 此后，没有发生其他错误。

Answer 8

我遇到了同样的问题，并按照以下步骤轻松解决了

电脑规格：macOS 版本 10.14.6

1. 如果找不到here如何安装，请确保已安装 R。
2. 如果没有找到here，请确保您安装了 jupyter notebook。
3. 转到终端或使用 Launchpad 启动 R，然后安装以下软件包：devtools::install_github('IRkernel/IRkernel')。
4. 使用：system.file('kernelspec', package = 'IRkernel') 找出它的安装位置，并使用您在下面的公共处获得的路径（我的是：/Users/ali/Library/R/4.0/library/IRkernel/kernelspec）。
5. 现在再次转到终端并输入：jupyter kernelspec install /Users/ali/Library/R/4.0/library/IRkernel/kernelspec --name 'R' --user。
6. 最后一件事是检查内核列表并使用上面@Bryan Prazen 的 cmd 4 和 5 重新启动笔记本。

享受吧！

Answer 9

在 Windows 10 系统中 您只需移动 R 库中的 3 个文件（在此步骤之前安装“IRkernel”） 到 你的 jupyter-lab “ir” 路径

希望对你有帮助！

Answer 10

对于Mac用户：

我遇到了同样的问题。您应该通过R在终端中呼叫IRkernel::installspec(user = FALSE)。我用这种方法解决了，我敢打赌您也可以这样做：

1. 在R控制台中调用R.home()
2. 您将获得[1] "/Library/Frameworks/R.framework/Resources"
3. 将/bin/R添加到路径n，如下所示：/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R
4. 在终端中，粘贴此路径/Library/Frameworks/R.framework/Resources/bin/R并输入。
5. 现在您在终端中使用R。致电IRkernel::installspec(user = FALSE) 然后应该解决。

Answer 11

我正在运行Ubuntu 18.04.4，其中R安装在/ usr / bin / R中，Python安装在/ home / ubuntu / anaconda3 / bin / python中。当试图告诉Jupyter在哪里为我的R安装找到内核时，我遇到了许多与路径有关的问题。无论我如何运行R，IRkernel :: installspec（）都无法在R中运行。通过在命令行中使用jupyter kernelspec建立连接，我找到了成功。具体来说，这对我有用。

在R内：

install.packages("devtools")
devtools::install_github("IRkernel/IRkernel")
system.file('kernelspec', package = 'IRkernel')

最后一行应为您提供Jupyter查找内核所需的位置。我的是/home/ubuntu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/IRkernel/kernelspec

从命令行：

1. 检查在R中收到的路径。 是其中的.json文件。
2. jupyter kernelspec list（运行为 确保jupyter在您的路径中，您应该看到有关 当前可用的内核。
3. jupyter kernelspec install /home/ubuntu/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/4.0/IRkernel/kernelspec --name 'R' --user（您将使用在R中工作时收到的路径，该路径可能不同）
4. jupyter kernelspec list（此列表现在应包含R）
5. 重新启动jupyter

Answer 12

我不使用conda-我安装了python虚拟env和R。 我不知道这是否重要，但是我正在ubuntu for Windows（WSL）上运行（可能是导致我出错的原因，可能无关）。 在控制台中，它识别出jupyter。在R控制台中，我安装了IRkernel，但IRkernel :: installspec（）给了我以上错误（无法识别jupyter）。 我找不到有效的解决方案，因此我在这里写了为我解决的解决方案。 我发现了installspec here的内部。 先检查一下which jupyter所在的jupyter安装在哪里 并从命令行运行R。 然后，运行以下代码（根据上面的链接进行调整）：

 srcdir <- system.file('kernelspec', package = 'IRkernel')
 tmp_name <- tempfile()
 dir.create(tmp_name)
 file.copy(srcdir, tmp_name, recursive = TRUE)
 spec_path <- file.path(tmp_name, 'kernelspec', 'kernel.json')
 library(jsonlite)
 spec$argv[[1]] <- file.path(R.home('bin'), 'R')
 spec$display_name <- 'R'
 write(toJSON(spec, pretty = TRUE, auto_unbox = TRUE), file = spec_path)
 args <- c('kernelspec', 'install', '--replace', '--name', 'ir', file.path(tmp_name, 'kernelspec'))
 system2('/path/to/jupyter', args)  <--- here you copy paste the path you got earlier with pwd
 unlink(tmp_name, recursive = TRUE)

Answer 13

在Jupyter中尝试将我的环境安装为内核时遇到相同的错误。首先，我创建了一个新环境，在conda提示符内安装了R，IRkernel和devtools，然后运行R在提示符下键入R并键入

IRkernel::installspec(name = 'myenvname', displayname = 'myenvname')

我有同样的错误。 我解决了就是这样：

conda install -c anaconda jupyter_client

然后重新键入刚刚起作用的先前代码。

Answer 14

假设您已经在终端中运行R。您可以先致电library('IRkernel')，按Enter，然后致电installspec()或installspec(user=FALSE)。

对我来说，简单地致电IRkernel::installspec()总是会引起您在问题中提到的错误。我不知道为什么我在centos服务器上解决了这个问题。

Answer 15

我试图在Windows计算机上安装IRkernel。当我从R中运行时，我遇到了类似的问题：

> IRkernel::installspec(user = FALSE)
Error in IRkernel::installspec(user = FALSE) : 
  jupyter-client has to be installed but “jupyter kernelspec --version” exited with code 1.

我没有使用conda在计算机上安装Jupyter，而是使用pip。我安装了一些在后台使用python的程序。这意味着我的机器上有多个Python实例，也有更多的Jupyter实例。为了确保我引用了正确的Jupyter实例，我这样做了：

> setwd('C:/usr/lib/Python36-32/Scripts')
> IRkernel::installspec(user = FALSE)
[InstallKernelSpec] Installed kernelspec ir in C:\ProgramData\jupyter\kernels\ir

除了Python，我现在还可以在笔记本中使用R。

Answer 16

对于Windows用户，安装anaconda后，应重新启动系统，以便在启动时出现Anaconda提示符。打开Anaconda Prompt后，输入

IRkernel :: installspec（）

这一次它将起作用，因为我认为重新启动要升级系统的'cuz PATH。

Answer 17

我遇到了同样的问题，但是以上解决方案都不适合我。我将Debian 9与python和R的默认版本一起使用。我必须删除已安装的程序，并从源代码中编译这两个程序的最新版本。对于Python编译，我必须使用此配置https://github.com/sloria/TextBlob/issues/173

Answer 18

这里是克服此问题的一种方法。我已经在Mac中安装了带有Anaconda的IRkernel（我猜在Linux上也是一样）

我输入：

conda install -c r r-irkernel

然后我开始输入R：

R

最后，我已经安装了kernelspec来向Jupyter讲述IRkernel，并带有用于在全局环境中安装的选项user = FALSE：

IRkernel::installspec(user=FALSE)

希望有帮助！

Answer 19

我有同样的问题；我在〜/ .bashrc（和source）中添加了以下内容，然后尝试运行IRkernel::installspec()，它起作用了：

export PATH="~/anaconda3/bin:$PATH"

Answer 20

我遇到了同样的错误，但在我的情况下，我在虚拟环境中安装了jupyter，所以我必须在安装虚拟环境后启动R，以便IRkernel :: installspec（）成功。