Survminer
会产生很好的情节,但有没有办法通过常规ggplot
命令进一步改变结果?
我尝试做的是让y轴在原点开始,如here所述。 对于常规的ggplot,这很有效,但我不能让它与幸存者一起工作:
library(survival)
library(survminer)
df<-genfan
df$treat<-sample(c(0,1),nrow(df),replace=TRUE)
fit <- survfit(Surv(hours, status) ~ treat,
data = df)
p<-ggsurvplot(fit, data = df, risk.table = TRUE,,ncensor.plot=FALSE,tables.theme = theme_cleantable(),
ggtheme = theme_survminer(font.legend=c(12,"bold","black") ))
p%+%scale_x_continuous(expand=c(0,0))%+%scale_y_continuous(expand=c(0,0))
这会产生错误
&#34;缩放&#39; y&#39;已经存在了。为&#39; y&#39;添加另一个比例,它将取代现有比例。&#34;
以及其他错误
&#34;错误:提供给连续刻度的离散值&#34;
有什么方法吗?
答案 0 :(得分:2)
问题的可能解决方案是修改ggsurvplot
和ggrisktable
在适当的位置插入expand=c(0,0)
。
在此link,您可以找到我的提案。
点击&#34;下载&#34;并将文件a_modified_ggsurvplot.txt
保存在您的工作目录中
然后运行以下代码:
library(survival)
library(survminer)
df <- genfan
df$treat <- sample(c(0,1),nrow(df),replace=TRUE)
fit <- survfit(Surv(hours, status) ~ treat, data = df)
source("a_modified_ggsurvplot.txt")
p <- myggsurvplot(fit, data = df, risk.table = TRUE,
ncensor.plot=FALSE,tables.theme = theme_cleantable(),
ggtheme = theme_survminer(font.legend=c(12,"bold","black")))
print(p)
希望它可以帮助你。