ggiraph中geom_line_interactive缺少工具提示

Question

我想向ggsurvplot添加工具提示。我正在使用ggiraph来显示情节。由于ggiraph没有geom_step_interactive，我正在操纵ggsurvplot的数据输出以获取步进函数值，并使用geom_line_interactive覆盖我的ggsurvplot上的一行并添加工具提示。以下是正常运行的代码：

library(ggiraph)
library(survminer)
library(survival)

  #Function to get the step function points
  step_func <- function(data, direction="hv", x , y) {
    direction <- match.arg(direction, c("hv", "vh"))
    data <- as.data.frame(data)[order(data[, x]), ]
    n <- nrow(data)

    if (n <= 1) {
      # Need at least one observation
      return(data[0, , drop = FALSE])
    }

    if (direction == "vh") {
      xs <- rep(1:n, each = 2)[-2*n]
      ys <- c(1, rep(2:n, each = 2))
    } else {
      ys <- rep(1:n, each = 2)[-2*n]
      xs <- c(1, rep(2:n, each = 2))
    }

    return(data.frame(
      x = data[,x][xs],
      y = data[,y][ys],
      data[xs, setdiff(names(data), c(x, y))]
    ))
  }



  fit<- survfit(Surv(time, status) ~ sex, data = lung )
  g <- ggsurvplot(fit, data = lung, risk.table = TRUE,
                  risk.table.pos= "out", risk.table.y.text = TRUE)

  dat1 <- plyr::ddply(g$plot$data, "strata", step_func, "hv", "time", "surv")
  dat1$tooltip <- paste0("Time:", dat1$x)
  gg<- g$plot+geom_line_interactive(data = dat1, aes(x= x, y=y, colour = strata, tooltip= tooltip ), size = .75)
  ggiraph(code = print(gg))

使用上面的代码，我得到了以下图表，其中包含工具提示，如图所示：

我希望工具提示不仅显示时间而且还显示生存概率，因为我稍微更改了代码，如下所示：

dat1$tooltip <- paste0("Time:", dat1$x, "Surv:", dat1$y )

这会导致工具提示消失。

我做错了什么？

Answer 1

当geom_line_interactive工具提示过长时，似乎消失了。您可以截断值结果以使它们保持简短。以下作品：

dat1$tooltip <- paste0("Time:", dat1$x, " Surv:", round(dat1$y,2) )

但将值设置为3会导致它们消失。我并不完全确定这一点，因为工具提示非常繁琐，似乎只有当鼠标位于正确的位置时才会出现。它可能是所有超过一定长度的都被抑制了。

但我确实注意到，如果您使用geom_point_interactive代替geom_line_interactve并使用较大的size参数值，则整个工具提示功能会更好。这可能是你想要做的。

可能是geom_line_interactive忽略了size参数。

此数字为geom_point_interactive，上面的round参数设置为3，size设置为1.75，效果更好。