从列表中导出多个回归的摘要

时间:2017-05-10 19:47:20

标签: r regression lm

我有一个使用标准数据集mtcars通过此代码完成的多个回归列表。

models <- lapply(paste("mpg", names(mtcars)[-1], sep = "~"), formula)
res.models <- lapply(models, FUN = function(x) {summary(lm(formula = x, data = mtcars))})
names(res.models) <- paste("mpg", names(mtcars)[-1], sep = "~")

我现在有一个针对第一列的多个回归列表&#34; mpg&#34;。从这里我试图导出某些摘要统计数据,如;截距,系数和r.squared。

我尝试过使用下面包含的循环。

for (i in 1:length(res.models))
{
  res <- res.models[[i]]
  res_bound <- NULL
  intercept <- res$coefficients[1]
  coef <- res$coefficients[2]
  r <- res$r.squared
  res_bound <- cbind(intercept, coef, r)
}

虽然这给我一个dataframe,但它只包含上一个回归模型的结果,即1行乘3列dataframe。此外,我想有&#34;术语&#34;表中每个回归的区别,以区分我正在查看的模型(例如mpg vs cyl或mpg vs hp)。

我只是错过了循环中的一个步骤吗?最终目标是write.csv最终dataframe

2 个答案:

答案 0 :(得分:4)

您可以使用purrr::map_dfbroom::glance应用于每个模型,然后将结果收集到data.frame中:

purrr::map_df(res.models, broom::glance, .id = 'formula')
#>     formula r.squared adj.r.squared    sigma statistic      p.value df
#> 1   mpg~cyl 0.7261800     0.7170527 3.205902 79.561028 6.112687e-10  2
#> 2  mpg~disp 0.7183433     0.7089548 3.251454 76.512660 9.380327e-10  2
#> 3    mpg~hp 0.6024373     0.5891853 3.862962 45.459803 1.787835e-07  2
#> 4  mpg~drat 0.4639952     0.4461283 4.485409 25.969645 1.776240e-05  2
#> 5    mpg~wt 0.7528328     0.7445939 3.045882 91.375325 1.293959e-10  2
#> 6  mpg~qsec 0.1752963     0.1478062 5.563738  6.376702 1.708199e-02  2
#> 7    mpg~vs 0.4409477     0.4223126 4.580827 23.662241 3.415937e-05  2
#> 8    mpg~am 0.3597989     0.3384589 4.902029 16.860279 2.850207e-04  2
#> 9  mpg~gear 0.2306734     0.2050292 5.373695  8.995144 5.400948e-03  2
#> 10 mpg~carb 0.3035184     0.2803024 5.112961 13.073646 1.084446e-03  2

您可以为系数broom::tidy执行类似的操作,或为残差添加broom::augment。请注意,扫帚功能旨在在模型本身上调用,而不是摘要,但如果您愿意,可以将整个内容保留在管道中:

library(purrr)

names(mtcars)[-1] %>% 
    paste('mpg ~', .) %>%    # or start with `models` at this point
    map(lm, data = mtcars) %>% 
    map_df(broom::glance, .id = 'formula')
#>    formula r.squared adj.r.squared    sigma statistic      p.value df
#> 1        1 0.7261800     0.7170527 3.205902 79.561028 6.112687e-10  2
#> 2        2 0.7183433     0.7089548 3.251454 76.512660 9.380327e-10  2
#> 3        3 0.6024373     0.5891853 3.862962 45.459803 1.787835e-07  2
#> 4        4 0.4639952     0.4461283 4.485409 25.969645 1.776240e-05  2
#> 5        5 0.7528328     0.7445939 3.045882 91.375325 1.293959e-10  2
#> 6        6 0.1752963     0.1478062 5.563738  6.376702 1.708199e-02  2
#> 7        7 0.4409477     0.4223126 4.580827 23.662241 3.415937e-05  2
#> 8        8 0.3597989     0.3384589 4.902029 16.860279 2.850207e-04  2
#> 9        9 0.2306734     0.2050292 5.373695  8.995144 5.400948e-03  2
#> 10      10 0.3035184     0.2803024 5.112961 13.073646 1.084446e-03  2
#>       logLik      AIC      BIC deviance df.residual
#> 1  -81.65321 169.3064 173.7036 308.3342          30
#> 2  -82.10469 170.2094 174.6066 317.1587          30
#> 3  -87.61931 181.2386 185.6358 447.6743          30
#> 4  -92.39996 190.7999 195.1971 603.5667          30
#> 5  -80.01471 166.0294 170.4266 278.3219          30
#> 6  -99.29406 204.5881 208.9853 928.6553          30
#> 7  -93.07356 192.1471 196.5443 629.5193          30
#> 8  -95.24219 196.4844 200.8816 720.8966          30
#> 9  -98.18192 202.3638 206.7611 866.2980          30
#> 10 -96.59033 199.1807 203.5779 784.2711          30

请注意,您将获得一些额外的变量,这些变量不能包含在摘要中。

答案 1 :(得分:3)

如果你想在基地R:

中这样做
res <- lapply(seq_along(res.models), function(i) {

  data.frame(model = names(res.models)[i],
             intercept = res.models[[i]]$coefficients[1],
             coef = res.models[[i]]$coefficients[2],
             r = res.models[[i]]$r.squared,
             stringsAsFactors = FALSE)

})

do.call(rbind, res)

输出:

      model intercept        coef         r
1   mpg~cyl 37.884576 -2.87579014 0.7261800
2  mpg~disp 29.599855 -0.04121512 0.7183433
3    mpg~hp 30.098861 -0.06822828 0.6024373
4  mpg~drat -7.524618  7.67823260 0.4639952
5    mpg~wt 37.285126 -5.34447157 0.7528328
6  mpg~qsec -5.114038  1.41212484 0.1752963
7    mpg~vs 16.616667  7.94047619 0.4409477
8    mpg~am 17.147368  7.24493927 0.3597989
9  mpg~gear  5.623333  3.92333333 0.2306734
10 mpg~carb 25.872334 -2.05571870 0.3035184

seq_along(res.models)而非res.models的原因是,我们还可以获取列表中相关插槽的名称,并将其放入您正在制作的数据框中。