这是数据集的样本
Umls Snomed
C0027497/Nausea /Sign or Symptom Nausea (finding)[FN/422587007]
C0151786 / Muscle/Sign or Symptom Muscle weakness [(finding) /FN/26544005]
C2127305 /bitter/ Sign or Symptom ?
NA NA
这是我创建数据字典的代码:
df_dic_1= df_dic_1[['UMLS', 'snomed']]
df_dic_1['umls'].fillna(0, inplace=True)
df_dic_1['snomed'].fillna(0, inplace=True)
equiv_snomed=df_dic_1.set_index('umls')['snomed'].to_dict()
但它会产生以下错误:
" return self._engine.get_loc(key)"
任何帮助?
答案 0 :(得分:1)
试试这个
df_dic_1= df_dic_1[['UMLS', 'snomed']]
df_dic_1['UMLS'].fillna(0, inplace=True)
df_dic_1['snomed'].fillna(0, inplace=True)
equiv_snomed=df_dic_1.set_index('UMLS')['snomed'].to_dict()
因为您有密钥错误
答案 1 :(得分:1)
2列使用5个不同的列名:
示例中的 Umls
,代码中的UMLS
和umls
示例中为Snomed
,代码中为snomed
您需要通过以下方式检查:
print (df.columns.tolist())
并使用正确的。
e.g。如果样本中的名称正确:
f_dic_1= df_dic_1[['Umls', 'Snomed']]
df_dic_1['Umls'].fillna(0, inplace=True)
df_dic_1['Snomed'].fillna(0, inplace=True)
equiv_snomed=df_dic_1.set_index('Umls')['Snomed'].to_dict()