bash：grep模式来自文件并计算不同的选项

Question

我有一个包含以下结构的多行的txt文件：

@HISEQ:XXX:8:1101:11058:2481 1:N:0:ATTCCTTTTCTTTCCC
@HISEQ:XXX:8:1101:11009:2489 1:N:0:ATCACGATTATTTCCC
@HISEQ:XXX:8:1101:1414:2364 1:N:0:GCCAATATCCTTTCCC
@HISEQ:XXX:8:1101:11009:2489 1:N:0:ATCACGATTATTTCCC

现在我想要了解最后一个＆＃39; <＃39;

背后的模式

在这种情况下，它将是：

ATTCCTTTTCTTTCCC
ATCACGATTATTTCCC
GCCAATATCCTTTCCC
ATCACGATTATTTCCC

然后，我想计算每个模式的找到次数。

这样的事情：

ATTCCTTTTCTTTCCC: 1
ATCACGATTATTTCCC: 2
GCCAATATCCTTTCCC: 1

这可以用bash完成吗？

Answer 1

使用awk你可以这样做：

awk -F: '{print $NF; tok[$NF]++} END {
   print "==== Uniques ==="; for (i in tok) print i, tok[i]}' file

ATTCCTTTTCTTTCCC
ATCACGATTATTTCCC
GCCAATATCCTTTCCC
ATCACGATTATTTCCC
==== Uniques ===
ATTCCTTTTCTTTCCC 1
GCCAATATCCTTTCCC 1
ATCACGATTATTTCCC 2

Answer 2

您可以使用sed删除:之前的所有内容，然后使用uniq排序以计算出现次数：

sed 's/.*://' file | sort | uniq -c

Answer 3

static int max(int a, int b) { return (a > b)? a : b; }