我试图绘制一些神经网络输出,但我没有得到任何结果。绘制像plot(iris)
这样的普通内容的工作正常,但是neuralnetwork()
对象的某些内容似乎没有相同的方式。
我的文件如下:
---
title: "stack"
author: "stack"
date: "today"
output:
pdf_document: default
html_document: default
---
```{r}
library(neuralnet)
AND <- c(rep(0,3),1)
binary.data <- data.frame(expand.grid(c(0,1), c(0,1)), AND)
net <- neuralnet(AND~Var1+Var2, binary.data, hidden=0,err.fct="ce", linear.output=FALSE)
plot(net)
```
我没有输出。同样的文件绘制其他东西就好了。有什么想法吗?
答案 0 :(得分:9)
此问题has been reported之前已在 rmarkdown 存储库中得到解答。在这里,我只是试图解释它为什么不起作用的技术原因。
从帮助页面?neuralnet::plot.nn
:
Usage
## S3 method for class 'nn'
plot(x, rep = NULL, x.entry = NULL, x.out = NULL,
....
Arguments
...
rep repetition of the neural network. If rep="best", the repetition
with the smallest error will be plotted. If not stated all repetitions
will be plotted, each in a separate window.
从源代码(v1.33):
> neuralnet:::plot.nn
function (x, rep = NULL, x.entry = NULL, x.out = NULL, radius = 0.15,
....
{
....
if (is.null(rep)) {
for (i in 1:length(net$weights)) {
....
grDevices::dev.new()
plot.nn(net, rep = i,
....
}
}
我已使用上面的....
省略了irrelvant信息。基本上,如果您未指定rep
,neuralnet:::plot.nn
将打开新的图形设备来绘制图表。这将打破 knitr 的图形录制,因为
dev.control(displaylist = 'enable')
); 我不是 neuralnet 包的作者,但我建议作者放弃dev.new()
,或至少使其成为条件,例如
if (interactive()) grDevices::dev.new()
我想dev.new()
调用的意图可能是在新窗口中显示情节,但实际上无法保证用户可以看到窗口。 交互式 R会话的默认图形设备是窗口/屏幕设备(如果可用,例如x11()
或quartz()
),但默认设备很可能具有已被用户或包裹作者更改。
我建议使用条件interactive()
,因为对于非交互式R会话,打开新设备(默认情况下,屏幕外)设备可能没什么意义。
答案 1 :(得分:2)
我认为问题在于,对于课程git branch --all
的对象,nn
使用参数plot
。如果未定义rep
,则所有重复都绘制在单独的窗口中(在RMarkdown之外运行时)。如果rep
,则仅生成具有最小错误的图。所以这应该有效:
rep = "best"
请参阅```{r}
library(neuralnet)
AND <- c(rep(0,3),1)
binary.data <- data.frame(expand.grid(c(0,1), c(0,1)), AND)
net <- neuralnet(AND~Var1+Var2, binary.data, hidden=0,err.fct="ce",
linear.output=FALSE)
plot(net, rep = "best")
```
。