问：无法在DSX的R笔记本中安装DTW算法

Question

我正在尝试在DSX的R笔记本中安装R的DTW包。 运行install命令时：     install.packages（ “DTW”） 给出以下错误：     “安装包'dtw'具有非零退出状态”警告。

Answer 1

安装尝试的其他输出可以在R内核的日志文件中找到。在R笔记本中，执行

Sys.getenv("LOG_FILE")

获取日志文件的名称。然后打开Python笔记本并执行

!cat <name-of-the-log-file>

查看日志文件的内容。

尝试安装dtw后，我的日志文件显示：

gcc -std=gnu99 -shared -L/usr/local/lib64 -o dtw.so computeCM.o Launching java with spark-submit command /usr/local/src/spark20master/spark/bin/spark-submit sparkr-shell /gpfs/fs01/user/s10d-7f8820dde34dec-4cf890276e2b/notebook/tmp/RtmpofrZnw/backend_portd1c4793df5e

看起来像写入同一日志文件的两个进程的乱码日志输出。但是进一步下来，我发现：

gcc: error: Launching: No such file or directory
gcc: error: java: No such file or directory
gcc: error: with: No such file or directory
gcc: error: spark-submit: No such file or directory
gcc: error: command: No such file or directory
gcc: error: sparkr-shell: No such file or directory
gcc: error: /gpfs/fs01/user/s10d-7f8820dde34dec-4cf890276e2b/notebook/tmp/Rtmpkh93V2/backend_porte8853270b27: No such file or directory
make: *** [dtw.so] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘dtw’

因此实际执行了乱码。我说dtw包的安装逻辑会对DSX中不满足的环境做出一些假设。

要进一步深入研究问题，您必须调试dtw安装程序，或者找一个能为您做到这一点的人。