Question

等待一周后，三个MC链运行，对象不是保存，给出错误“错误：is.atomic（x）不为TRUE”。我跑了这段代码或其变体很多次，所以它可能不是我的语法，但可能是关于对象大小或内部的东西 stan_glmer错误？日志在下面，感谢您的帮助（也是关于如何保存中间链的建议很有用！）

stan.T.mod <- stan_glmer(form2, iter=5000, warmup=5000, thin=1, 
  family = binomial(link = "logit"), prior = student_t(location=0, df = 1, scale = 2.5), 
  prior_intercept = student_t(location=0, df = 1, scale=2.5),
  prior_covariance = decov(shape = 10, scale = 1), 
  chains = 3, seed = 0305991, data=Tbinary.dt)

模型'bernoulli'NOW（CHAIN 1）的采样。

Chain 1，Iteration：1/5000 [0％]（Warmup）Chain 1，Iteration：   500/5000 [10％]（热身）链1，迭代次数：1000/5000 [20％]   （热身）链1，迭代次数：1500/5000 [30％]（热身）链1，   迭代次数：2000/5000 [40％]（预热）链1，迭代次数：2500 /   5000 [50％]（热身）链1，迭代次数：3000/5000 [60％]（热身）   链1，迭代：3500/5000 [70％]（预热）链1，迭代：   4000/5000 [80％]（热身）链1，迭代次数：4500/5000 [90％]   （热身）链1，迭代：5000/5000 [100％]（热身）经过   时间：394305秒（热身）                  0秒（采样）                  394305秒（总计）

模型'bernoulli'NOW（CHAIN 2）的采样。

链2，迭代：1/5000 [0％]（热身）链2，迭代：   500/5000 [10％]（热身）链2，迭代次数：1000/5000 [20％]   （热身）链2，迭代：1500/5000 [30％]（热身）链2，   迭代次数：2000/5000 [40％]（预热）链2，迭代次数：2500 /   5000 [50％]（热身）链2，迭代次数：3000/5000 [60％]（热身）   链2，迭代：3500/5000 [70％]（热身）链2，迭代：   4000/5000 [80％]（热身）链2，迭代次数：4500/5000 [90％]   （热身）链2，迭代：5000/5000 [100％]（热身）经过   时间：434251秒（热身）                  0秒（采样）                  434251秒（总计）

模型'bernoulli'NOW（CHAIN 3）的采样。

链3，迭代：1/5000 [0％]（热身）链3，迭代：   500/5000 [10％]（热身）链3，迭代次数：1000/5000 [20％]   （热身）链3，迭代：1500/5000 [30％]（热身）链3，   迭代次数：2000/5000 [40％]（热身）链3，迭代次数：2500 /   5000 [50％]（热身）链3，迭代次数：3000/5000 [60％]（热身）   链3，迭代：3500/5000 [70％]（预热）链3，迭代：   4000/5000 [80％]（热身）链3，迭代次数：4500/5000 [90％]   （热身）连锁3，迭代：5000/5000 [100％]（热身）经过   时间：345070秒（热身）                  0秒（采样）                  345070秒（总计）

错误：is.atomic（x）不为TRUE

save(stan.T.mod, file=paste0(outpath, "stan.GCMfixedmods"));

保存时出错（stan.T.mod，file = paste0（outpath，“stan.GCMfixedmods”））：
  找不到对象'stan.T.mod'


stan.T.mod错误：未找到对象'stan.T.mod'

Stan_glmer对象分配错误

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