Question

当我尝试打印使用re.search方法检索的对象时，我遇到了错误。这是输出：

$ ./io.py

无

虽然我已成功将正则表达式存储在对象列表中，但看起来在将参数传递给re.match（）方法时会出现一些错误。

有人能给我一个暗示吗？

提前致谢！

以下是代码：

# -*- coding: utf-8 -*-
import io
import re

# my regular expressions
exprs = [ """r"Gene ID: (.*)\,""", """r"(.*)\[Homo sapiens]""", 
          """r"from:(.*)\s""",  """r"NM_(.*)\.([0-9]+)""" ,     
          """r"NP_(.*)\.([0-9]+)\s""", """r"\,(.*)[^coding]exons""",  
          """r"AA length:(.*)\s""", """r"isoform(.*)\\NP""" ]


# search for expressions vector in genetable
for element in exprs:
    arq = open('massaCHD8.txt', "r")
    resu = re.search(element, arq.read(), re.M|re.I)
    print(resu)
    arq.close()

Answer 1

您似乎尝试使用原始字符串，但请将它们用引号括起来。

而不是

"""r"Gene ID: (.*)\,"""

尝试：

r"Gene ID: (.*)\,"

在正则表达式中，*是贪婪的，因此它会匹配所有内容直到最后,。那是你的意图吗？

请注意，\,表示,，因为逗号不是特殊字符。如果您想匹配反斜杠后跟逗号，请使用\\, ，即使在原始字符串正则表达式中。

此外，您为每个正则表达式重新读取整个文件。您应该在循环之前阅读文件内容。

with open('massaCHD8.txt', "r") as df: arq = df.read() for element in exprs: results = re.search(element, arq)

请注意，搜索只会找到第一个匹配！如果您想查找所有匹配项，请改用re.findall。

正则表达式作为python上的列表

1 个答案: